42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2775 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  264  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  50.5 
 
 		 224 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  49.44 
 
 		 251 aa  85.9  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  43.12 
 
 		 198 aa  83.6  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  45.35 
 
 		 221 aa  77  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  43.02 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  36.78 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  41.43 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  34.95 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  55.56 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  45.45 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  43.66 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  36.26 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  43.94 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  40 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  36.11 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  34.69 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  37.66 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  32.76 
 
 		 223 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  41.94 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  36.05 
 
 		 249 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  52.78 
 
 		 197 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  39.44 
 
 		 199 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  40.28 
 
 		 204 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  35.71 
 
 		 198 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  38.71 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  38.46 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  30.19 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  30.43 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  48.57 
 
 		 200 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  52.78 
 
 		 258 aa  47.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  38.03 
 
 		 232 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1447  hypothetical protein  52.17 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.979821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  34.72 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  43.59 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  35.21 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  44.68 
 
 		 220 aa  43.5  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  41.03 
 
 		 203 aa  43.5  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  45.71 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  34.29 
 
 		 190 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  34.43 
 
 		 212 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>