45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1350 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  539  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  86.05 
 
 
165 aa  297  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  79.65 
 
 
172 aa  278  9e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  40.32 
 
 
198 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  31.73 
 
 
232 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  54.29 
 
 
200 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  32.13 
 
 
221 aa  122  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  30.89 
 
 
204 aa  115  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  30.62 
 
 
220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  29.53 
 
 
198 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  32.24 
 
 
192 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  31.23 
 
 
197 aa  108  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  28.29 
 
 
251 aa  105  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  31.4 
 
 
199 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  26.51 
 
 
224 aa  98.6  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  29.29 
 
 
249 aa  95.1  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  26.94 
 
 
206 aa  92.4  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  44.32 
 
 
201 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  28.74 
 
 
207 aa  89.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  43.18 
 
 
239 aa  89  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  45.28 
 
 
223 aa  88.2  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  39.62 
 
 
174 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  39.62 
 
 
168 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  42 
 
 
193 aa  85.1  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  48.15 
 
 
107 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  47.19 
 
 
127 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  47.19 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  25.93 
 
 
196 aa  82  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  26.25 
 
 
192 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  48.1 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  42.17 
 
 
187 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  41.18 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  47.73 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  47.73 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  27.24 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  41.76 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  43.68 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  37.5 
 
 
179 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  28.03 
 
 
200 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  39.24 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  40.45 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  37.97 
 
 
203 aa  74.7  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  36.36 
 
 
152 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  35.63 
 
 
190 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  52.78 
 
 
129 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>