49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1529 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  409  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  39.7 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  43.37 
 
 
199 aa  136  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  38.54 
 
 
193 aa  134  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  38.1 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  37.3 
 
 
206 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  36.46 
 
 
190 aa  122  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  37.84 
 
 
197 aa  121  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  36.41 
 
 
177 aa  121  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  35.08 
 
 
223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  36.84 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  36.11 
 
 
193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  36.61 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  33.68 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  34.43 
 
 
203 aa  109  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  33.88 
 
 
203 aa  108  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  34.41 
 
 
249 aa  108  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  35.83 
 
 
200 aa  107  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  34.72 
 
 
192 aa  104  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  30.98 
 
 
207 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  33.83 
 
 
200 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  33.15 
 
 
185 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  33.15 
 
 
219 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  31.67 
 
 
163 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  34.07 
 
 
196 aa  99.8  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  31.11 
 
 
163 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  30.85 
 
 
204 aa  95.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  33.51 
 
 
174 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  32.64 
 
 
197 aa  92  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  30.96 
 
 
239 aa  92.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  28.29 
 
 
224 aa  91.7  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  29.28 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  30.73 
 
 
198 aa  89  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  30.98 
 
 
197 aa  87.8  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  27.15 
 
 
232 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  44.32 
 
 
152 aa  85.1  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  46.84 
 
 
127 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  29.72 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  26.25 
 
 
258 aa  82  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  27.35 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  38.96 
 
 
107 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3111  hypothetical protein  35 
 
 
64 aa  52  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  21.82 
 
 
153 aa  47.8  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  36.67 
 
 
172 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  46.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  32.79 
 
 
153 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  25.15 
 
 
178 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  22.29 
 
 
152 aa  41.6  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>