42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0779 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  225  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  56.79 
 
 		 196 aa  104  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  58.97 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  57.5 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  51.09 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  48.39 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  57.5 
 
 		 174 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  55.56 
 
 		 239 aa  100  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  50.57 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  58.75 
 
 		 204 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  51.76 
 
 		 220 aa  97.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  56.1 
 
 		 206 aa  97.4  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  51.22 
 
 		 249 aa  97.1  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  52.27 
 
 		 223 aa  96.7  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  48.28 
 
 		 177 aa  95.5  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  44.55 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  50 
 
 		 193 aa  95.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  44.55 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  52.44 
 
 		 203 aa  95.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  43.14 
 
 		 201 aa  94.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  49.38 
 
 		 203 aa  94.4  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  50.6 
 
 		 193 aa  93.6  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  51.9 
 
 		 204 aa  93.2  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  55.7 
 
 		 251 aa  93.2  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  49.4 
 
 		 197 aa  90.9  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  47.67 
 
 		 200 aa  90.9  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  49.38 
 
 		 198 aa  90.9  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  53.85 
 
 		 221 aa  89.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  50 
 
 		 199 aa  89.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  48.15 
 
 		 179 aa  88.6  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  50.63 
 
 		 232 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  46.25 
 
 		 219 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  48.75 
 
 		 198 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  48.15 
 
 		 258 aa  83.6  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  45 
 
 		 185 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  47.5 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  43.59 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  38.04 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  41.3 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  38.96 
 
 		 190 aa  67.4  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  38.96 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  44.12 
 
 		 200 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>