43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4519 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  315  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  43.62 
 
 
219 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  44.32 
 
 
192 aa  85.5  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  42.17 
 
 
190 aa  84  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  41.49 
 
 
185 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  35.14 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  43.68 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  45.88 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  40.51 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  40.51 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  39.02 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  37.74 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  37.74 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  37.93 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  42.35 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  43.59 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  38.82 
 
 
201 aa  74.3  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  44.32 
 
 
197 aa  74.3  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  43.4 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  36.44 
 
 
187 aa  72  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  36.89 
 
 
204 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  33.93 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  41.25 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  39.56 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  39.02 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  37.04 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  46.67 
 
 
249 aa  68.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  34.91 
 
 
207 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  38.64 
 
 
223 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  34.78 
 
 
196 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  39.33 
 
 
206 aa  67  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  39.51 
 
 
193 aa  67  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  38.38 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  42.17 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  33.96 
 
 
251 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  34.67 
 
 
224 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  38.27 
 
 
198 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  37.66 
 
 
221 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  35.9 
 
 
232 aa  62.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  36.36 
 
 
258 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  38.75 
 
 
204 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  30 
 
 
197 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  34.85 
 
 
180 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>