59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2239 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  53.72 
 
 		 198 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  44.21 
 
 		 177 aa  158  5e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  43.59 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  43.62 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  43.62 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  44.09 
 
 		 185 aa  151  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  42.55 
 
 		 200 aa  148  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  38.59 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  37.78 
 
 		 203 aa  143  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  43.01 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  36.67 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  43.32 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  39.8 
 
 		 239 aa  135  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  38.22 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  40.8 
 
 		 220 aa  134  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  39.06 
 
 		 192 aa  134  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  37.7 
 
 		 196 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  36.96 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  40.22 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  38.22 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  40.5 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  37.56 
 
 		 204 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  41.49 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  42.54 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  42.86 
 
 		 168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  32.65 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  37.7 
 
 		 163 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  37.7 
 
 		 163 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  32.76 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  33.16 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  32.64 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  31.75 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  31.28 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  31.68 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  34.03 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  95.1  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  30.43 
 
 		 258 aa  94.4  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  29.95 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  31.38 
 
 		 200 aa  87.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  39.51 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  46.15 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  47.54 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  21.02 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  28.83 
 
 		 178 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  24.4 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  21.67 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  23.53 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  22.84 
 
 		 152 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  20.61 
 
 		 153 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  24.18 
 
 		 171 aa  45.1  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  25.78 
 
 		 177 aa  44.7  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  23.93 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  25.78 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  21.23 
 
 		 1372 aa  42.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  45.71 
 
 		 129 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  21.92 
 
 		 1345 aa  42  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  22.36 
 
 		 161 aa  41.6  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>