49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0544 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  57.89 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  45.21 
 
 		 198 aa  190  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  44.81 
 
 		 192 aa  175  5e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  47.32 
 
 		 224 aa  168  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  41.2 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  41.18 
 
 		 196 aa  156  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  42.6 
 
 		 204 aa  151  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  39.67 
 
 		 232 aa  148  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  38.91 
 
 		 197 aa  148  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  38.07 
 
 		 179 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  37.21 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  41.2 
 
 		 199 aa  138  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  37.96 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  39.37 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  36.87 
 
 		 174 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  34.23 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  37.04 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  38.64 
 
 		 197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  36.36 
 
 		 168 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  36.59 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  36.59 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  34.11 
 
 		 163 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  34.11 
 
 		 163 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  32.13 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  35.71 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  33.81 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  37.39 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  35.94 
 
 		 223 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  37.9 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  31.63 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  35.27 
 
 		 220 aa  111  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  30.52 
 
 		 185 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  34.13 
 
 		 187 aa  104  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  49.43 
 
 		 127 aa  89.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  29.68 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  53.85 
 
 		 107 aa  89.4  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  28.29 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  29.72 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  45.35 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  25.84 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  43.02 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  37.66 
 
 		 152 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  31.03 
 
 		 165 aa  52  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  31.03 
 
 		 172 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0788  hypothetical protein  61.54 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.716296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  43.75 
 
 		 1345 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  43.75 
 
 		 1372 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0388533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>