179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3170 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  64.11 
 
 		 189 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  54.19 
 
 		 187 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  58.99 
 
 		 164 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  51.85 
 
 		 177 aa  148  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  55.84 
 
 		 180 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  55.48 
 
 		 176 aa  144  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3156  arginine repressor  58.45 
 
 		 184 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  49.42 
 
 		 185 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22280  transcriptional regulator, ArgR family  53.95 
 
 		 175 aa  143  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.772386  normal  0.886844 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2368  arginine repressor, ArgR  51.65 
 
 		 184 aa  142  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  hitchhiker  0.0059772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  56.08 
 
 		 184 aa  141  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  55.48 
 
 		 186 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21690  transcriptional regulator, ArgR family  54.3 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.253364  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  57.55 
 
 		 159 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  52.2 
 
 		 167 aa  138  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  57.55 
 
 		 159 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  57.55 
 
 		 159 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3525  arginine repressor  56.03 
 
 		 161 aa  138  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  56.67 
 
 		 168 aa  138  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11675  arginine repressor  54.3 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.20822e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  56.83 
 
 		 178 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25580  transcriptional regulator, ArgR family  52.52 
 
 		 171 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  47.31 
 
 		 177 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3309  arginine repressor  56.52 
 
 		 161 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0125249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1332  arginine repressor, ArgR  55.86 
 
 		 172 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0268167  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1116  arginine repressor, ArgR  53.42 
 
 		 195 aa  135  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  46.81 
 
 		 188 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  50.69 
 
 		 168 aa  131  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1893  arginine repressor  52.6 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547671  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1886  arginine repressor, ArgR  52.6 
 
 		 171 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00411801  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  50 
 
 		 161 aa  119  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14370  transcriptional regulator, ArgR family  52.17 
 
 		 162 aa  115  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2836  arginine repressor  52.52 
 
 		 172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122938  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0811  Arginine repressor  41.77 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.142208  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4126  arginine repressor, ArgR  52.55 
 
 		 162 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10236  hitchhiker  0.0000243081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3067  arginine repressor, ArgR  54.93 
 
 		 186 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0673  arginine repressor, C-terminal domain protein  43.42 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1660  arginine repressor, ArgR  44.52 
 
 		 160 aa  96.7  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.442675  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0066  arginine repressor  37.59 
 
 		 141 aa  95.5  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.558575  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1395  arginine repressor, ArgR  45.19 
 
 		 152 aa  95.1  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0815  ArgR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 153 aa  95.1  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1897  arginine repressor, ArgR  36.11 
 
 		 150 aa  93.6  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000423478  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  34.97 
 
 		 150 aa  89.4  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2102  arginine repressor ArgR, putative  34.69 
 
 		 145 aa  88.6  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  39.44 
 
 		 150 aa  88.6  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  33.57 
 
 		 150 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  33.57 
 
 		 150 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2160  ArgR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 161 aa  85.1  8e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  36.49 
 
 		 152 aa  85.1  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2363  arginine repressor, ArgR  33.33 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1334  arginine repressor, ArgR  36.3 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  30.08 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2580  arginine repressor, ArgR  34.25 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  43.57 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  30.67 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  30.67 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4162  ArgR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 148 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00922797  normal  0.12838 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  36.57 
 
 		 150 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4195  arginine repressor  31.16 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2845299999999995e-37 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4305  arginine repressor  31.16 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4247  arginine repressor  31.16 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2317  arginine repressor  31.03 
 
 		 149 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4079  arginine repressor  31.16 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000890152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3917  arginine repressor  31.16 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.90108e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3928  arginine repressor  31.16 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4398  arginine repressor  31.16 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0949  arginine repressor  31.16 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000274725  decreased coverage  0.00000185245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4285  arginine repressor  31.16 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2868  arginine repressor  31.16 
 
 		 149 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.904403  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1324  ArgR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1543  arginine repressor  32.89 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  34 
 
 		 149 aa  77.8  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2508  arginine repressor, ArgR  34.56 
 
 		 152 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0153884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0253  arginine repressor  31.72 
 
 		 149 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2316  arginine repressor, ArgR  36.81 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  32.39 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4027  arginine repressor  30.43 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000656189  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2340  arginine repressor, ArgR  35.42 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04740  arginine repressor  37.5 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.159421 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1249  arginine repressor, ArgR  34.59 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  35.34 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2324  ArgR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1508  ArgR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  41.13 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  41.13 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1180  transcriptional repressor protein, putative  34.29 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000314701  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1028  arginine repressor, ArgR  28.47 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1045  arginine repressor  36.11 
 
 		 148 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.775166 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1784  arginine repressor  33.8 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0406  arginine repressor  28.97 
 
 		 149 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0471  arginine repressor  28.97 
 
 		 149 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4745  arginine repressor, ArgR  33.88 
 
 		 162 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2884  ArgR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0131006  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4714  arginine repressor, ArgR  33.88 
 
 		 162 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371163  normal  0.633002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4864  arginine repressor ArgR  33.88 
 
 		 162 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4808  arginine repressor ArgR  33.88 
 
 		 162 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.777034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4844  arginine repressor ArgR  33.88 
 
 		 162 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1379  arginine repressor, ArgR  34.27 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0586  ArgR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>