69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0788 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0788  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.716296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5800  hypothetical protein  80.58 
 
 		 149 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  50.53 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  33.77 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  45.78 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  46.39 
 
 		 524 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  56.25 
 
 		 639 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  31.55 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1733  hypothetical protein  38.1 
 
 		 177 aa  57  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  49.37 
 
 		 813 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  42.06 
 
 		 347 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  42.06 
 
 		 347 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  48.78 
 
 		 459 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  38.66 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  46.59 
 
 		 643 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4355  triple helix repeat-containing collagen  64 
 
 		 369 aa  52.4  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.105642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  58.33 
 
 		 606 aa  52.4  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  53.66 
 
 		 815 aa  52  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  61.54 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  56 
 
 		 1219 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 748 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  44.19 
 
 		 585 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  40 
 
 		 712 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  54.32 
 
 		 1055 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3836  leucyl aminopeptidase  68.89 
 
 		 575 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0130732 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  60 
 
 		 380 aa  48.9  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  47.31 
 
 		 390 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  51.19 
 
 		 462 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  52.24 
 
 		 295 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  43.33 
 
 		 426 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  48.72 
 
 		 867 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  41 
 
 		 512 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4674  cell surface protein  52.5 
 
 		 939 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0699989  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  41.86 
 
 		 842 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  47.44 
 
 		 835 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  47.44 
 
 		 936 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  48.28 
 
 		 469 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  45.68 
 
 		 835 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  34.48 
 
 		 492 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4661  cell surface protein  51.28 
 
 		 907 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  48.28 
 
 		 647 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4281  cell surface protein  51.28 
 
 		 953 aa  46.2  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.533345  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  47.83 
 
 		 1168 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2199  collagen-like protein  58 
 
 		 286 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.76687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  45.24 
 
 		 706 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  37.78 
 
 		 1408 aa  45.4  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2201  exosporium protein H  61.7 
 
 		 428 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4893  collagen triple helix repeat protein  54 
 
 		 230 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  50 
 
 		 300 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  41.76 
 
 		 1297 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  58.18 
 
 		 348 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1354  sulfatase  40.68 
 
 		 621 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4887  collagen triple helix repeat protein  52.83 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  40.82 
 
 		 478 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  43.16 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  40.82 
 
 		 481 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2244  exosporium protein H  56 
 
 		 435 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.800271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  51.14 
 
 		 1580 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  35.96 
 
 		 1198 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  47.69 
 
 		 587 aa  43.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  47.95 
 
 		 1451 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  60 
 
 		 326 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4079  BclA protein  58 
 
 		 314 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  59.57 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  42.67 
 
 		 582 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  37.14 
 
 		 438 aa  42.4  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1245  Collagen triple helix repeat protein  52.83 
 
 		 309 aa  42.4  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.160346  normal  0.403174 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  40.26 
 
 		 1321 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1405  spore coat assembly protein-like protein  38.78 
 
 		 709 aa  41.6  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.430258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>