More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3836 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3836  leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 575 aa  1089    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0130732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0880  leucyl aminopeptidase  59.32 
 
 		 616 aa  571  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  47.67 
 
 		 491 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3016  leucyl aminopeptidase  45.91 
 
 		 479 aa  359  9e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  43.77 
 
 		 501 aa  334  3e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1180  Leucyl aminopeptidase  46.81 
 
 		 485 aa  333  4e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746121  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3894  Leucyl aminopeptidase  42.11 
 
 		 505 aa  311  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1834  leucyl aminopeptidase  43.82 
 
 		 502 aa  310  5e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1032  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06390  leucyl aminopeptidase  42.32 
 
 		 488 aa  296  7e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1149  Leucyl aminopeptidase  45.28 
 
 		 516 aa  286  5.999999999999999e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.901079  normal  0.0342275 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2924  Leucyl aminopeptidase  41.27 
 
 		 524 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827489 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25920  leucyl aminopeptidase  44.42 
 
 		 527 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118194  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  38.63 
 
 		 497 aa  282  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1207  leucyl aminopeptidase  42.96 
 
 		 527 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1104  Leucyl aminopeptidase  40.54 
 
 		 503 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0809  Leucyl aminopeptidase  37.38 
 
 		 537 aa  273  6e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  42.79 
 
 		 482 aa  273  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0710  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  43.53 
 
 		 488 aa  270  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  43.09 
 
 		 487 aa  270  7e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  38.59 
 
 		 497 aa  266  5e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1466  Leucyl aminopeptidase  40.4 
 
 		 490 aa  265  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445132 
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  38.38 
 
 		 497 aa  265  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  37.7 
 
 		 518 aa  265  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  39.92 
 
 		 511 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  37.3 
 
 		 510 aa  264  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  37.3 
 
 		 510 aa  264  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1607  Leucyl aminopeptidase  39.71 
 
 		 507 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000366671 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  37.3 
 
 		 510 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  37.14 
 
 		 511 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  37.14 
 
 		 511 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  41.15 
 
 		 503 aa  263  8.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2684  hypothetical protein  40.45 
 
 		 483 aa  262  1e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  37.14 
 
 		 511 aa  262  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  39.49 
 
 		 488 aa  262  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1613  leucyl aminopeptidase  40.47 
 
 		 508 aa  261  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000981229  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2556  hypothetical protein  40.17 
 
 		 483 aa  260  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  36.91 
 
 		 510 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  41.94 
 
 		 500 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0959  cytosol aminopeptidase  37.72 
 
 		 511 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  35.23 
 
 		 503 aa  258  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0789  Leucyl aminopeptidase  42.05 
 
 		 455 aa  257  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  38.27 
 
 		 496 aa  257  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  34.59 
 
 		 492 aa  257  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  37.87 
 
 		 497 aa  256  8e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  38.51 
 
 		 503 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  35.95 
 
 		 518 aa  254  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  38.14 
 
 		 498 aa  254  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2646  Leucyl aminopeptidase  38.48 
 
 		 507 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  40.38 
 
 		 495 aa  253  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3765  Leucyl aminopeptidase  35.26 
 
 		 493 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  37.04 
 
 		 496 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1187  Leucyl aminopeptidase  38.54 
 
 		 496 aa  252  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0133955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  37.11 
 
 		 496 aa  252  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0526  leucyl aminopeptidase  40.31 
 
 		 502 aa  251  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0735759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  35.61 
 
 		 491 aa  251  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3910  leucyl aminopeptidase  35.37 
 
 		 491 aa  250  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.723186  normal  0.561505 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  43.92 
 
 		 514 aa  249  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  41.6 
 
 		 497 aa  249  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3861  leucyl aminopeptidase  35.37 
 
 		 491 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  39.16 
 
 		 496 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  36.76 
 
 		 511 aa  248  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  41.8 
 
 		 498 aa  247  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0657  leucyl aminopeptidase  42.94 
 
 		 488 aa  248  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0633269  hitchhiker  0.00350753 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17591  leucyl aminopeptidase  34.86 
 
 		 495 aa  247  4e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1874  Leucyl aminopeptidase  47.34 
 
 		 497 aa  247  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219143  normal  0.0871837 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2306  leucyl aminopeptidase  37.25 
 
 		 497 aa  246  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.942842  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  35.46 
 
 		 528 aa  246  6e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1364  Leucyl aminopeptidase  41.29 
 
 		 492 aa  246  6e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0903  leucyl aminopeptidase  34.86 
 
 		 495 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03635  leucyl aminopeptidase  40.69 
 
 		 502 aa  246  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0069  leucyl aminopeptidase  33.79 
 
 		 496 aa  246  9e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  34.3 
 
 		 501 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  37.45 
 
 		 497 aa  246  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  37.88 
 
 		 497 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  36.67 
 
 		 492 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4097  leucyl aminopeptidase  38.57 
 
 		 518 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.128156  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002428  cytosol aminopeptidase PepA  40.96 
 
 		 502 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00175472  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  34.46 
 
 		 503 aa  244  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0516  leucyl aminopeptidase  32.29 
 
 		 495 aa  244  3e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.204663  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1781  leucyl aminopeptidase  36.26 
 
 		 490 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_901  cytosol aminopeptidase/leucyl aminopeptidase  35.08 
 
 		 495 aa  244  3e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0210903  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0910  leucyl aminopeptidase  41.32 
 
 		 502 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000452493  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  39.6 
 
 		 497 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0051  leucyl aminopeptidase  39.49 
 
 		 559 aa  244  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1518  Leucyl aminopeptidase  39.46 
 
 		 505 aa  244  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222641  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  36.68 
 
 		 503 aa  244  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0871  leucyl aminopeptidase  40.88 
 
 		 502 aa  243  6e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238632  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  38.1 
 
 		 500 aa  243  7.999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0939  leucyl aminopeptidase  41.44 
 
 		 502 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.245826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0296  leucyl aminopeptidase  31.08 
 
 		 488 aa  242  1e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00770459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0628  leucyl aminopeptidase  42.19 
 
 		 496 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.052928  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0795  leucyl aminopeptidase  35.37 
 
 		 502 aa  242  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2083  leucyl aminopeptidase  40.16 
 
 		 503 aa  242  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000600102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  36.2 
 
 		 496 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  38.4 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  38.46 
 
 		 512 aa  242  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3276  Leucyl aminopeptidase  45.85 
 
 		 499 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187039  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  35.62 
 
 		 495 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  40.27 
 
 		 506 aa  241  2.9999999999999997e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  37.1 
 
 		 500 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>