More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3937 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  92.96 
 
 
497 aa  897    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  74.9 
 
 
503 aa  729    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  100 
 
 
497 aa  981    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5835  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  69.74 
 
 
500 aa  673    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  93.56 
 
 
497 aa  907    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5097  leucyl aminopeptidase  68.54 
 
 
500 aa  627  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803796  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  58 
 
 
500 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  59.92 
 
 
499 aa  561  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  58.4 
 
 
498 aa  559  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  58.8 
 
 
500 aa  558  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  58.2 
 
 
500 aa  553  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  57.6 
 
 
496 aa  541  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  57.2 
 
 
496 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  57.6 
 
 
500 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  56.25 
 
 
499 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  58 
 
 
500 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  56.34 
 
 
539 aa  523  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  56.35 
 
 
542 aa  524  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  55.58 
 
 
497 aa  519  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  54.84 
 
 
495 aa  505  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  57.39 
 
 
497 aa  495  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  52.89 
 
 
497 aa  482  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  57.14 
 
 
498 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  52.89 
 
 
497 aa  481  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  59.41 
 
 
497 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  53.2 
 
 
500 aa  435  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  51.98 
 
 
493 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1227  leucyl aminopeptidase  49.48 
 
 
494 aa  431  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.494822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  57.26 
 
 
487 aa  411  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  49.46 
 
 
488 aa  411  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  57.81 
 
 
489 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0249677 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  49.38 
 
 
514 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1815  leucyl aminopeptidase  48.17 
 
 
488 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1761  leucyl aminopeptidase  50.67 
 
 
481 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  48.04 
 
 
500 aa  397  1e-109  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  47.31 
 
 
489 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  52.12 
 
 
500 aa  387  1e-106  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  52.12 
 
 
500 aa  385  1e-106  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0890  leucyl aminopeptidase  54.5 
 
 
485 aa  382  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119935  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1543  leucyl aminopeptidase  46.79 
 
 
489 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2899  leucyl aminopeptidase  46.58 
 
 
489 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0950  leucyl aminopeptidase  46.03 
 
 
491 aa  363  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111685  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0903  leucyl aminopeptidase  45.14 
 
 
533 aa  353  5e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  42.3 
 
 
508 aa  342  7e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  43.98 
 
 
497 aa  339  8e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  44.05 
 
 
506 aa  338  9.999999999999999e-92  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  41.31 
 
 
510 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  41.31 
 
 
510 aa  334  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  41.31 
 
 
510 aa  334  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  45.59 
 
 
487 aa  333  6e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2996  leucyl aminopeptidase  40.09 
 
 
515 aa  330  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  40.86 
 
 
510 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  41.08 
 
 
518 aa  329  6e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  40.63 
 
 
511 aa  327  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  40.63 
 
 
511 aa  327  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  40.63 
 
 
511 aa  326  6e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0959  cytosol aminopeptidase  41.53 
 
 
511 aa  320  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  45.01 
 
 
488 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  39.96 
 
 
491 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  41.69 
 
 
496 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  42.02 
 
 
506 aa  311  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  46.34 
 
 
482 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  42.22 
 
 
496 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  42.48 
 
 
497 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  40.22 
 
 
492 aa  309  9e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  42.08 
 
 
512 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  40.85 
 
 
498 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2389  leucyl aminopeptidase  43.38 
 
 
556 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0738051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  39.91 
 
 
496 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  41.84 
 
 
496 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  41.29 
 
 
497 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  41.05 
 
 
497 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0296  leucyl aminopeptidase  35.55 
 
 
488 aa  300  5e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00770459 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  43.02 
 
 
492 aa  300  6e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  42.54 
 
 
500 aa  299  7e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  36.49 
 
 
493 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  39.62 
 
 
495 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  36.43 
 
 
493 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0628  leucyl aminopeptidase  42.96 
 
 
496 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.052928  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1368  leucyl aminopeptidase  38.03 
 
 
502 aa  297  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  40.28 
 
 
497 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  40.14 
 
 
496 aa  296  4e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2827  leucyl aminopeptidase  37.82 
 
 
502 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.246514  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2909  leucyl aminopeptidase  37.82 
 
 
502 aa  296  6e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.112327  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0795  leucyl aminopeptidase  37.18 
 
 
502 aa  296  6e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  39.9 
 
 
495 aa  296  7e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3006  leucyl aminopeptidase  37.82 
 
 
502 aa  295  9e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.132109  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  38.49 
 
 
503 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0516  leucyl aminopeptidase  37.17 
 
 
495 aa  295  1e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.204663  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0098  leucyl aminopeptidase  39.47 
 
 
491 aa  294  2e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  38.38 
 
 
518 aa  295  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0388  leucyl aminopeptidase  37.99 
 
 
510 aa  294  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00389759  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1178  leucyl aminopeptidase  37.18 
 
 
502 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3109  leucyl aminopeptidase  37.18 
 
 
502 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000897805  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0623  leucyl aminopeptidase  40.95 
 
 
536 aa  293  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022147  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3119  leucyl aminopeptidase  37.18 
 
 
502 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000969621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3262  leucyl aminopeptidase  37.18 
 
 
502 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0507418  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1257  leucyl aminopeptidase  37.18 
 
 
502 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0396745  hitchhiker  0.0000114036 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2595  leucyl aminopeptidase  44.14 
 
 
486 aa  293  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0344474 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  43.49 
 
 
497 aa  293  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>