More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_901 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1030  cytosol aminopeptidase family protein  86.26 
 
 
495 aa  896    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.414121  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0913  leucyl aminopeptidase  89.9 
 
 
497 aa  923    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00605227  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_901  cytosol aminopeptidase/leucyl aminopeptidase  100 
 
 
495 aa  1005    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0210903  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  40.12 
 
 
497 aa  352  8.999999999999999e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1364  Leucyl aminopeptidase  40.72 
 
 
492 aa  348  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  38.63 
 
 
496 aa  344  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  40 
 
 
495 aa  339  8e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  39.69 
 
 
512 aa  339  8e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  39.15 
 
 
488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  40.45 
 
 
491 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  39.96 
 
 
492 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3765  Leucyl aminopeptidase  39.56 
 
 
493 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  40.43 
 
 
482 aa  333  5e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  38.28 
 
 
487 aa  331  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  37.27 
 
 
493 aa  329  8e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1124  leucyl aminopeptidase  40.68 
 
 
485 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.67356  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  41.58 
 
 
511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  40.92 
 
 
496 aa  320  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1187  Leucyl aminopeptidase  40.24 
 
 
496 aa  318  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0133955  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  38.7 
 
 
493 aa  316  7e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  38.31 
 
 
496 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0038  leucyl aminopeptidase  36.27 
 
 
504 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3910  leucyl aminopeptidase  38.18 
 
 
491 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.723186  normal  0.561505 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2878  leucyl aminopeptidase  38.41 
 
 
497 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3861  leucyl aminopeptidase  37.98 
 
 
491 aa  312  9e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  39.17 
 
 
495 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  37.97 
 
 
496 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3023  leucyl aminopeptidase  38.41 
 
 
502 aa  307  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3886  Leucyl aminopeptidase  39.2 
 
 
524 aa  307  3e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.384144  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0580  leucyl aminopeptidase  37.1 
 
 
503 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458799  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5066  leucyl aminopeptidase  37.29 
 
 
494 aa  306  7e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3532  leucyl aminopeptidase  38.61 
 
 
493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  38.34 
 
 
503 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4653  leucyl aminopeptidase  37.29 
 
 
494 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0181  leucyl aminopeptidase  37.45 
 
 
494 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5060  leucyl aminopeptidase  37.29 
 
 
494 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1781  leucyl aminopeptidase  39.28 
 
 
490 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4792  leucyl aminopeptidase  37.08 
 
 
494 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4633  leucyl aminopeptidase  37.08 
 
 
494 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5032  leucyl aminopeptidase  37.08 
 
 
494 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  37.77 
 
 
528 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5155  leucyl aminopeptidase  37.08 
 
 
494 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  37.57 
 
 
497 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  35.94 
 
 
498 aa  303  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  38.48 
 
 
495 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4743  leucyl aminopeptidase  36.86 
 
 
494 aa  302  9e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0296  leucyl aminopeptidase  36.42 
 
 
488 aa  302  9e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00770459 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  35.06 
 
 
506 aa  301  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0069  leucyl aminopeptidase  38.32 
 
 
496 aa  300  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  37.99 
 
 
503 aa  300  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5057  leucyl aminopeptidase  37.03 
 
 
494 aa  300  5e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.708172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4642  Leucyl aminopeptidase  39.31 
 
 
480 aa  299  9e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  37.15 
 
 
496 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0628  leucyl aminopeptidase  40.52 
 
 
496 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.052928  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  37.89 
 
 
512 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0849  Leucyl aminopeptidase  40.62 
 
 
491 aa  296  5e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.531813  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  36.73 
 
 
518 aa  296  6e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2099  aminopeptidase A/I  37 
 
 
497 aa  295  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  37.15 
 
 
496 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1500  Leucyl aminopeptidase  38.32 
 
 
482 aa  295  1e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2727  leucyl aminopeptidase  37.86 
 
 
491 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  36.75 
 
 
496 aa  293  4e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4007  leucyl aminopeptidase  37.99 
 
 
486 aa  293  6e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.502988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  36.47 
 
 
499 aa  292  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2018  leucyl aminopeptidase  39.05 
 
 
490 aa  290  3e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0566  leucyl aminopeptidase  38.37 
 
 
478 aa  290  6e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  35.53 
 
 
501 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  35.79 
 
 
497 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  35.29 
 
 
511 aa  286  7e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2683  leucyl aminopeptidase  37.65 
 
 
510 aa  286  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417849  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  35.19 
 
 
497 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  35.39 
 
 
497 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2646  Leucyl aminopeptidase  38.11 
 
 
507 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3363  Leucyl aminopeptidase  37.34 
 
 
471 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  39.34 
 
 
497 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1710  Leucyl aminopeptidase  38.98 
 
 
501 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.055191  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  39.34 
 
 
497 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  39.33 
 
 
487 aa  283  5.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0114  leucyl aminopeptidase  36.67 
 
 
491 aa  283  7.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0098  leucyl aminopeptidase  36.67 
 
 
491 aa  282  1e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  39.62 
 
 
497 aa  282  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  39.48 
 
 
498 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  35.54 
 
 
503 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3091  Leucyl aminopeptidase  41.51 
 
 
545 aa  281  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00268238  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1857  Leucyl aminopeptidase  36.83 
 
 
500 aa  280  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2201  cytosol aminopeptidase  36.83 
 
 
500 aa  280  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152379  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  35.54 
 
 
503 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  35.26 
 
 
503 aa  279  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2807  leucyl aminopeptidase  35.98 
 
 
510 aa  279  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.494526  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  43.78 
 
 
503 aa  279  7e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2595  leucyl aminopeptidase  41.13 
 
 
486 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0344474 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1921  PepA aminopeptidase  45.83 
 
 
496 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428802  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  35.33 
 
 
503 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13861  leucyl aminopeptidase  36.65 
 
 
493 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0993846  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1725  Leucyl aminopeptidase  45.83 
 
 
496 aa  278  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0681  leucyl aminopeptidase  35.63 
 
 
499 aa  277  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.516579  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  35.67 
 
 
503 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  36.08 
 
 
508 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  43.2 
 
 
495 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  35.8 
 
 
496 aa  276  5e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>