More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3337 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
497 aa  993    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  59.88 
 
 
500 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  62.32 
 
 
499 aa  596  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  59.27 
 
 
500 aa  586  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  59.84 
 
 
498 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  64.65 
 
 
499 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  59.27 
 
 
500 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  59.27 
 
 
500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  58.27 
 
 
500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  59.27 
 
 
495 aa  566  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  61.22 
 
 
496 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  58.81 
 
 
496 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  58.72 
 
 
497 aa  549  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  58.52 
 
 
497 aa  546  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  61.79 
 
 
497 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  57.28 
 
 
542 aa  544  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  58.15 
 
 
500 aa  544  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  57.23 
 
 
498 aa  540  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5835  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  58.47 
 
 
500 aa  537  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  57.78 
 
 
539 aa  534  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5097  leucyl aminopeptidase  59.3 
 
 
500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803796  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  55.67 
 
 
497 aa  511  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  55.09 
 
 
497 aa  510  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  54.53 
 
 
503 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  55.51 
 
 
497 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  58.09 
 
 
493 aa  507  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  56.83 
 
 
497 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1227  leucyl aminopeptidase  53.1 
 
 
494 aa  488  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.494822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  56.32 
 
 
514 aa  475  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  54.16 
 
 
488 aa  460  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  52.31 
 
 
489 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0249677 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  50.31 
 
 
489 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  51.21 
 
 
500 aa  444  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  50.1 
 
 
487 aa  442  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1761  leucyl aminopeptidase  52.43 
 
 
481 aa  436  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  49.11 
 
 
500 aa  429  1e-119  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1815  leucyl aminopeptidase  50.4 
 
 
488 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  51.87 
 
 
500 aa  427  1e-118  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1543  leucyl aminopeptidase  50.52 
 
 
489 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2899  leucyl aminopeptidase  50.52 
 
 
489 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0890  leucyl aminopeptidase  52.5 
 
 
485 aa  420  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119935  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0903  leucyl aminopeptidase  48.35 
 
 
533 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0950  leucyl aminopeptidase  50.2 
 
 
491 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111685  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  45.38 
 
 
506 aa  376  1e-103  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  45.81 
 
 
497 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  45.79 
 
 
496 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2996  leucyl aminopeptidase  42.39 
 
 
515 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  46.41 
 
 
496 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  43.83 
 
 
508 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  42.67 
 
 
518 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  42.22 
 
 
510 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  42 
 
 
510 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  44.81 
 
 
496 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  42.13 
 
 
511 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  42.13 
 
 
511 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  42.4 
 
 
510 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  44.28 
 
 
491 aa  353  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  42.4 
 
 
510 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  42.13 
 
 
511 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  45.57 
 
 
496 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  43.27 
 
 
497 aa  351  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  42.94 
 
 
496 aa  348  9e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  43.84 
 
 
497 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2683  leucyl aminopeptidase  44.54 
 
 
510 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417849  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  45.74 
 
 
500 aa  347  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0959  cytosol aminopeptidase  42.57 
 
 
511 aa  347  4e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  42.95 
 
 
492 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  43.07 
 
 
506 aa  343  5e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1921  PepA aminopeptidase  45.91 
 
 
496 aa  343  5e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428802  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  44.16 
 
 
512 aa  342  9e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  45.02 
 
 
508 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  43.2 
 
 
497 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  43.41 
 
 
497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1725  Leucyl aminopeptidase  45.7 
 
 
496 aa  339  5e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  43.2 
 
 
497 aa  339  8e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  44.3 
 
 
498 aa  338  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0871  leucyl aminopeptidase  42.42 
 
 
502 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0924  leucyl aminopeptidase  43.2 
 
 
502 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317075  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  45.02 
 
 
508 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0795  leucyl aminopeptidase  42.89 
 
 
502 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  43.51 
 
 
492 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1178  leucyl aminopeptidase  42.89 
 
 
502 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2827  leucyl aminopeptidase  42.89 
 
 
502 aa  336  5e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.246514  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2909  leucyl aminopeptidase  42.67 
 
 
502 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.112327  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1368  leucyl aminopeptidase  42.46 
 
 
502 aa  335  7e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2219  leucyl aminopeptidase  43.85 
 
 
502 aa  336  7e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  43.14 
 
 
503 aa  336  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  43.14 
 
 
503 aa  336  7e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3006  leucyl aminopeptidase  42.67 
 
 
502 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.132109  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3119  leucyl aminopeptidase  42.67 
 
 
502 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000969621  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  42.92 
 
 
503 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2679  leucyl aminopeptidase  43.44 
 
 
502 aa  335  9e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273234  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  43.14 
 
 
503 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  43.14 
 
 
503 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  43.14 
 
 
503 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3262  leucyl aminopeptidase  42.67 
 
 
502 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0507418  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1257  leucyl aminopeptidase  42.67 
 
 
502 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0396745  hitchhiker  0.0000114036 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  43.14 
 
 
503 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0623  leucyl aminopeptidase  57.48 
 
 
536 aa  334  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022147  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3109  leucyl aminopeptidase  42.67 
 
 
502 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000897805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>