More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1104 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1104  Leucyl aminopeptidase  100 
 
 
503 aa  952    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06390  leucyl aminopeptidase  55.41 
 
 
488 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  49.55 
 
 
491 aa  350  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0789  Leucyl aminopeptidase  57.6 
 
 
455 aa  338  9e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3016  leucyl aminopeptidase  49.1 
 
 
479 aa  332  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  47.2 
 
 
501 aa  329  8e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1180  Leucyl aminopeptidase  49.38 
 
 
485 aa  326  5e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746121  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1834  leucyl aminopeptidase  46.79 
 
 
502 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1032  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0880  leucyl aminopeptidase  44.47 
 
 
616 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1207  leucyl aminopeptidase  45.36 
 
 
527 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  44.16 
 
 
497 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0710  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  50 
 
 
488 aa  300  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3894  Leucyl aminopeptidase  44.29 
 
 
505 aa  297  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0657  leucyl aminopeptidase  45.64 
 
 
488 aa  290  6e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0633269  hitchhiker  0.00350753 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1149  Leucyl aminopeptidase  47.95 
 
 
516 aa  287  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.901079  normal  0.0342275 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  44.42 
 
 
488 aa  286  5.999999999999999e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  43.48 
 
 
487 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2924  Leucyl aminopeptidase  43.11 
 
 
524 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  45.88 
 
 
482 aa  283  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25920  leucyl aminopeptidase  48.6 
 
 
527 aa  283  7.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118194  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2099  aminopeptidase A/I  38.43 
 
 
497 aa  278  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41187  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  43.32 
 
 
503 aa  277  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1004  Leucyl aminopeptidase  53.39 
 
 
531 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3836  leucyl aminopeptidase  46.45 
 
 
575 aa  272  9e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0130732 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0296  leucyl aminopeptidase  34.61 
 
 
488 aa  271  2e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00770459 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  47.27 
 
 
503 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  46.77 
 
 
503 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1030  cytosol aminopeptidase family protein  37.27 
 
 
495 aa  267  4e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.414121  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  39.74 
 
 
510 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  39.74 
 
 
510 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  39.51 
 
 
510 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  39.52 
 
 
518 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  39.56 
 
 
510 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  38.26 
 
 
492 aa  263  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4097  leucyl aminopeptidase  45.86 
 
 
518 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.128156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0328  leucyl aminopeptidase  45.5 
 
 
530 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0360646  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  38.81 
 
 
500 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  39.12 
 
 
511 aa  261  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  39.12 
 
 
511 aa  261  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  39.51 
 
 
528 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2306  leucyl aminopeptidase  42.33 
 
 
497 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.942842  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1466  Leucyl aminopeptidase  43.93 
 
 
490 aa  259  7e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445132 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0913  leucyl aminopeptidase  35.53 
 
 
497 aa  259  8e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00605227  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1518  Leucyl aminopeptidase  43.7 
 
 
505 aa  259  9e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  38.86 
 
 
491 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  38.9 
 
 
511 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1187  Leucyl aminopeptidase  39.74 
 
 
496 aa  258  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0133955  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  39.83 
 
 
508 aa  258  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  38.59 
 
 
497 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0008  Leucyl aminopeptidase  40.57 
 
 
502 aa  256  6e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1607  Leucyl aminopeptidase  41.41 
 
 
507 aa  256  6e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000366671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3765  Leucyl aminopeptidase  37.39 
 
 
493 aa  256  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0500  Leucyl aminopeptidase  44.54 
 
 
474 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000407784  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  37.81 
 
 
495 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  42.93 
 
 
511 aa  255  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0959  cytosol aminopeptidase  39.91 
 
 
511 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  37.32 
 
 
503 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1613  leucyl aminopeptidase  41.38 
 
 
508 aa  255  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000981229  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_901  cytosol aminopeptidase/leucyl aminopeptidase  35.64 
 
 
495 aa  254  3e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0210903  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  41.3 
 
 
496 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0809  Leucyl aminopeptidase  40.27 
 
 
537 aa  253  5.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3073  Leucyl aminopeptidase  42.86 
 
 
515 aa  253  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4525  Leucyl aminopeptidase  41.44 
 
 
491 aa  253  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1364  Leucyl aminopeptidase  37.11 
 
 
492 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  36.77 
 
 
501 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  39.8 
 
 
497 aa  252  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  40.56 
 
 
497 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3321  leucyl aminopeptidase  41.33 
 
 
513 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.177595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2646  Leucyl aminopeptidase  43.11 
 
 
507 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0871  leucyl aminopeptidase  37.05 
 
 
502 aa  251  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4642  Leucyl aminopeptidase  43.88 
 
 
480 aa  251  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3310  leucyl aminopeptidase  41.33 
 
 
513 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1124  leucyl aminopeptidase  44.27 
 
 
485 aa  250  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.67356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3372  leucyl aminopeptidase  41.33 
 
 
513 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.183674 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02660  leucyl aminopeptidase  40.66 
 
 
490 aa  250  5e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2519  leucyl aminopeptidase  41.82 
 
 
522 aa  249  6e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.164338  normal  0.0174769 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  41.3 
 
 
503 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  41.3 
 
 
503 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  37 
 
 
503 aa  249  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  39.48 
 
 
496 aa  249  8e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2408  PepA aminopeptidase  39.5 
 
 
507 aa  249  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.729851  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4388  Leucyl aminopeptidase  43.14 
 
 
490 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2847  Leucyl aminopeptidase  40.19 
 
 
462 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  45.54 
 
 
511 aa  248  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3720  leucyl aminopeptidase  39.31 
 
 
502 aa  249  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  35.99 
 
 
512 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  37.24 
 
 
496 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10530  leucyl aminopeptidase  44.64 
 
 
498 aa  248  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46137  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2169  leucyl aminopeptidase  40.45 
 
 
510 aa  248  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  36.14 
 
 
508 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  40.78 
 
 
503 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4222  Leucyl aminopeptidase  44.85 
 
 
518 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.345657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  36.2 
 
 
503 aa  248  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  40.78 
 
 
503 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  37.32 
 
 
497 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4247  Leucyl aminopeptidase  45.07 
 
 
518 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0516  leucyl aminopeptidase  36.32 
 
 
495 aa  247  4e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.204663  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  36.8 
 
 
497 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0795  leucyl aminopeptidase  36.77 
 
 
502 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  37.07 
 
 
508 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>