More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2847 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2847  Leucyl aminopeptidase  100 
 
 
462 aa  938    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4525  Leucyl aminopeptidase  58.5 
 
 
491 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  55.06 
 
 
503 aa  341  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  44.4 
 
 
528 aa  334  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  52.85 
 
 
503 aa  332  9e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  51.74 
 
 
503 aa  330  4e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  52.09 
 
 
511 aa  319  7e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  47.59 
 
 
497 aa  307  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0954  leucyl aminopeptidase  52.03 
 
 
508 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  47.3 
 
 
491 aa  306  6e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  48.36 
 
 
482 aa  305  8.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  47.06 
 
 
492 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  43.75 
 
 
495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  46.06 
 
 
487 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  41.98 
 
 
511 aa  283  5.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06390  leucyl aminopeptidase  43.01 
 
 
488 aa  282  9e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  43.72 
 
 
506 aa  281  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  40.09 
 
 
496 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  44.53 
 
 
488 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  44.26 
 
 
499 aa  279  8e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  44.5 
 
 
498 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  42.21 
 
 
518 aa  278  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  48.65 
 
 
496 aa  277  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  45.26 
 
 
497 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  44.32 
 
 
498 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  45.53 
 
 
497 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2519  leucyl aminopeptidase  43.47 
 
 
522 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.164338  normal  0.0174769 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3720  leucyl aminopeptidase  49.33 
 
 
502 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  41.73 
 
 
492 aa  272  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  46.34 
 
 
500 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3016  leucyl aminopeptidase  48.23 
 
 
479 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  40.14 
 
 
496 aa  270  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0628  leucyl aminopeptidase  48.25 
 
 
496 aa  269  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.052928  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0388  leucyl aminopeptidase  48.49 
 
 
503 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0444  leucyl aminopeptidase  48.49 
 
 
503 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  48.87 
 
 
501 aa  269  8.999999999999999e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3886  Leucyl aminopeptidase  40.09 
 
 
524 aa  268  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.384144  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  42.42 
 
 
496 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  45.94 
 
 
493 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2730  Leucyl aminopeptidase  49.51 
 
 
511 aa  267  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  41.91 
 
 
487 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  49.67 
 
 
499 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3557  leucyl aminopeptidase  48 
 
 
502 aa  266  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0880  leucyl aminopeptidase  43.67 
 
 
616 aa  266  7e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  44.19 
 
 
497 aa  266  8e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  47.44 
 
 
500 aa  266  8e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1538  Leucyl aminopeptidase  45.45 
 
 
521 aa  266  8e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  41.53 
 
 
493 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  42.49 
 
 
496 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  43.01 
 
 
496 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  41.26 
 
 
493 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  43.65 
 
 
498 aa  264  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0296  leucyl aminopeptidase  40.6 
 
 
488 aa  264  3e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00770459 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1125  Leucyl aminopeptidase  40.22 
 
 
491 aa  264  3e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.013782  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2116  leucyl aminopeptidase  47.42 
 
 
479 aa  264  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  44.59 
 
 
496 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  38.58 
 
 
501 aa  263  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  45.33 
 
 
497 aa  263  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  44.65 
 
 
489 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_901  cytosol aminopeptidase/leucyl aminopeptidase  48.44 
 
 
495 aa  262  8.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0210903  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  43.02 
 
 
506 aa  262  8.999999999999999e-69  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2099  aminopeptidase A/I  42.34 
 
 
497 aa  261  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41187  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  44.63 
 
 
500 aa  262  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  48.87 
 
 
500 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  42.66 
 
 
503 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  42.7 
 
 
497 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  42.78 
 
 
491 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3562  leucyl aminopeptidase  40.98 
 
 
501 aa  260  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  41.27 
 
 
496 aa  260  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  43.1 
 
 
496 aa  259  7e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04126  leucyl aminopeptidase  47.49 
 
 
503 aa  259  8e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3737  Leucyl aminopeptidase  47.49 
 
 
503 aa  259  8e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662158  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4821  leucyl aminopeptidase  47.49 
 
 
503 aa  259  8e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301619  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4832  leucyl aminopeptidase  47.49 
 
 
503 aa  259  8e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000259407  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  43.37 
 
 
500 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5781  leucyl aminopeptidase  47.49 
 
 
503 aa  259  8e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0325394  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0580  leucyl aminopeptidase  45.31 
 
 
503 aa  259  8e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458799  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4740  leucyl aminopeptidase  47.49 
 
 
503 aa  259  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000218455  normal  0.712457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4516  leucyl aminopeptidase  47.49 
 
 
503 aa  259  8e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000167051  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3752  leucyl aminopeptidase  47.49 
 
 
503 aa  259  8e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102834  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04090  hypothetical protein  47.49 
 
 
503 aa  259  8e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0200795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  41.44 
 
 
496 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0681  leucyl aminopeptidase  50.17 
 
 
499 aa  258  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.516579  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  41.55 
 
 
495 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1364  Leucyl aminopeptidase  39.25 
 
 
492 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  42.12 
 
 
503 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3648  leucyl aminopeptidase  46.82 
 
 
503 aa  258  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.433879  normal  0.196646 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0500  Leucyl aminopeptidase  39.31 
 
 
474 aa  257  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000407784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  47.91 
 
 
500 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  48.06 
 
 
499 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1014  leucyl aminopeptidase  43.35 
 
 
502 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0465604  normal  0.808003 
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  46.93 
 
 
500 aa  257  3e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4826  leucyl aminopeptidase  47.16 
 
 
503 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.956713  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4863  leucyl aminopeptidase  47.16 
 
 
503 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0321011  normal  0.585074 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4763  leucyl aminopeptidase  47.16 
 
 
503 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000189037  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4882  leucyl aminopeptidase  47.16 
 
 
503 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.417344  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4733  leucyl aminopeptidase  47.16 
 
 
503 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.138793  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01576  leucyl aminopeptidase  46.49 
 
 
513 aa  257  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.327034  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0395  leucyl aminopeptidase  40 
 
 
504 aa  257  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1921  PepA aminopeptidase  42.02 
 
 
496 aa  256  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428802  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>