66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0508 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  412  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  45.88 
 
 		 174 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  42.57 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  45.31 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  44.85 
 
 		 196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  45.08 
 
 		 168 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  40.89 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  43.78 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  42.78 
 
 		 192 aa  155  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  45.31 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  42.19 
 
 		 179 aa  148  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  38.91 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  45.5 
 
 		 177 aa  147  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  41.87 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  40.41 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  40.93 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  39.69 
 
 		 163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  39.69 
 
 		 163 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  38.94 
 
 		 251 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  41.03 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  40.1 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  36.6 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  37.5 
 
 		 224 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  39.57 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  38.89 
 
 		 204 aa  130  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  39.22 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  38.58 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  35.68 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  39.9 
 
 		 197 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  38.54 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  41.49 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  36.98 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  36.46 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  35.32 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  36.32 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  30.85 
 
 		 190 aa  97.8  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  42.14 
 
 		 127 aa  93.2  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  32.64 
 
 		 192 aa  92  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  49.4 
 
 		 107 aa  90.9  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  33.51 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  41.76 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  44.32 
 
 		 152 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  52.78 
 
 		 129 aa  52  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  51.6  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  39.34 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  38.46 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  27.35 
 
 		 1345 aa  48.9  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  27.35 
 
 		 1372 aa  48.9  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  59.46 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  26.27 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  56.76 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  23.49 
 
 		 153 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  46.15 
 
 		 178 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  47.83 
 
 		 178 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  25.22 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  34.41 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  22.34 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  36.07 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  25.29 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  26.27 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  50 
 
 		 212 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  35.59 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  37.1 
 
 		 178 aa  42  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  23.49 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  29.79 
 
 		 175 aa  41.6  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  30.1 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>