109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1855 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  362  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  60.57 
 
 		 184 aa  229  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  56.9 
 
 		 178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  62.8 
 
 		 179 aa  217  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  58.86 
 
 		 184 aa  217  7e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  55.17 
 
 		 176 aa  214  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  56.1 
 
 		 164 aa  204  5e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  53.22 
 
 		 177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  48.85 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  55.06 
 
 		 161 aa  193  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  53.14 
 
 		 178 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  50.29 
 
 		 178 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  53.37 
 
 		 175 aa  187  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  48.57 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  50.31 
 
 		 178 aa  184  5e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  61.83 
 
 		 133 aa  176  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  49.1 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  54.42 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  43.43 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  43.58 
 
 		 179 aa  163  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  46.63 
 
 		 163 aa  163  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  46.15 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  46.15 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  46.15 
 
 		 165 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  45.56 
 
 		 165 aa  160  8.000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  46.15 
 
 		 165 aa  160  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  47.56 
 
 		 179 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  43.18 
 
 		 176 aa  158  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  44.17 
 
 		 159 aa  155  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  43.1 
 
 		 191 aa  150  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  45.51 
 
 		 187 aa  147  9e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  43.02 
 
 		 187 aa  145  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  41.24 
 
 		 171 aa  144  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  40.35 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  39.41 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  33.96 
 
 		 157 aa  88.6  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888b  hypothetical protein  58.7 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0301  hypothetical protein  58.7 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  25.47 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2244  transposase  29.1 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196666  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  29.82 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  26.99 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  32.58 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  25.53 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  28.66 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  29.37 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  27.14 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  27.52 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  29.91 
 
 		 152 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  27.78 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  34.34 
 
 		 1372 aa  52.4  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  26.92 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  25.64 
 
 		 197 aa  51.2  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  27.45 
 
 		 323 aa  50.8  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  33.33 
 
 		 1345 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  31.54 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  44.23 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  29.41 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  29.41 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  26.14 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  29.57 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  28.68 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  28.48 
 
 		 207 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  25.83 
 
 		 241 aa  48.5  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  23.08 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  29.66 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  28.3 
 
 		 200 aa  47.8  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  27.27 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  26.95 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  26.17 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  29.73 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  27.4 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  24.11 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  31.18 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3026  hypothetical protein  42.22 
 
 		 76 aa  45.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  26.02 
 
 		 314 aa  45.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  25.17 
 
 		 149 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0347  hypothetical protein  28.57 
 
 		 158 aa  45.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.119312  normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  27.74 
 
 		 176 aa  44.3  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  28.32 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  25.98 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  25.64 
 
 		 312 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  27.59 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  44.74 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33350  hypothetical protein  57.14 
 
 		 38 aa  43.9  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  28.72 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  24.56 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  31.25 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  27.97 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  25.2 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  26.22 
 
 		 310 aa  42.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  27.01 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  25.93 
 
 		 249 aa  42.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  26.14 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  27.27 
 
 		 316 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  26.85 
 
 		 322 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  22.3 
 
 		 150 aa  42  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  28.1 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  24.82 
 
 		 232 aa  42  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  29.79 
 
 		 197 aa  41.6  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>