73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2563 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  363  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  48.02 
 
 		 177 aa  164  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  47.1 
 
 		 157 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3353  protein of unknown function DUF1568  31.95 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.231762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  32.14 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2065  hypothetical protein  29.05 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  28.21 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0450  transposase  31.54 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  26.35 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  29.58 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  33.91 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  27.67 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  29.32 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  28.87 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  24.68 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  25.32 
 
 		 220 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  26 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  29.29 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  48.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3368  transposase  29.37 
 
 		 171 aa  48.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.863098  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  28 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  29.71 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  30.95 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  26.95 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  28.35 
 
 		 253 aa  45.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  26.62 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  30.36 
 
 		 224 aa  45.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  26.14 
 
 		 230 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  26.14 
 
 		 230 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  26.14 
 
 		 230 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  26.14 
 
 		 230 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2830  hypothetical protein  48.65 
 
 		 77 aa  45.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322225  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  29.03 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  26.97 
 
 		 322 aa  45.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  24.83 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  25.66 
 
 		 315 aa  45.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  25.6 
 
 		 235 aa  45.1  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  29.37 
 
 		 151 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  25.62 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  27.74 
 
 		 175 aa  44.3  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  25.15 
 
 		 187 aa  44.3  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  24.41 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  28.1 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  22.76 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  26.57 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  26.92 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  20.93 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  23.18 
 
 		 314 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  27.42 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  25.66 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  30.77 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  27.87 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  26.09 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  29.06 
 
 		 253 aa  42.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  24.68 
 
 		 187 aa  42  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  29.51 
 
 		 165 aa  42  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  24.83 
 
 		 222 aa  42  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  24.39 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  29.51 
 
 		 165 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  29.51 
 
 		 165 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  29.51 
 
 		 165 aa  42  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  25.4 
 
 		 251 aa  41.6  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  26.95 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  27.78 
 
 		 165 aa  42  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  25.47 
 
 		 232 aa  41.6  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  26.09 
 
 		 150 aa  41.6  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  28.32 
 
 		 313 aa  41.6  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  25.23 
 
 		 174 aa  41.2  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0487  transposase  23.23 
 
 		 222 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  22.44 
 
 		 236 aa  41.2  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  23.18 
 
 		 312 aa  40.8  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  22.89 
 
 		 179 aa  40.8  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  22.52 
 
 		 316 aa  40.8  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>