22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2830 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2830  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  161  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322225  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  59.15 
 
 
186 aa  83.6  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3026  hypothetical protein  50 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247877  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  48.65 
 
 
176 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  46.67 
 
 
312 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  46.67 
 
 
188 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  50 
 
 
314 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  46.15 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  50 
 
 
313 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  42.59 
 
 
277 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  37.74 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  42.31 
 
 
223 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  39.29 
 
 
187 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  40.74 
 
 
191 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  44 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0450  transposase  33.33 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  40 
 
 
315 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  36.67 
 
 
191 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  55.17 
 
 
316 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  31.88 
 
 
287 aa  40.4  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  34.55 
 
 
177 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  34.55 
 
 
157 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>