85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0768 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  361  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  60 
 
 		 178 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  59.88 
 
 		 184 aa  204  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  56.02 
 
 		 177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  55.21 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  54.22 
 
 		 176 aa  191  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  56.44 
 
 		 164 aa  188  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  54.6 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  53.37 
 
 		 175 aa  187  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  53.33 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  55.77 
 
 		 161 aa  183  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  56.29 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  53.61 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  50.59 
 
 		 180 aa  174  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  44.64 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  50.3 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  49.7 
 
 		 165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  47.34 
 
 		 176 aa  162  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  49.7 
 
 		 165 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  49.7 
 
 		 165 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  49.7 
 
 		 165 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  45.61 
 
 		 163 aa  160  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  46.67 
 
 		 165 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  52.74 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  47.73 
 
 		 179 aa  158  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  48.5 
 
 		 176 aa  157  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  45.88 
 
 		 179 aa  157  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  55.73 
 
 		 133 aa  154  6e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  44.85 
 
 		 159 aa  149  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  44.71 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  44.24 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  44.12 
 
 		 191 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  45.29 
 
 		 191 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  47.06 
 
 		 187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  47.31 
 
 		 187 aa  136  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  37.5 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2244  transposase  32.86 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196666  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  27.46 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  28.78 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888b  hypothetical protein  46.81 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0301  hypothetical protein  46.81 
 
 		 91 aa  54.3  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  27.66 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  34.62 
 
 		 197 aa  52.4  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  35.42 
 
 		 149 aa  48.9  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  23.57 
 
 		 241 aa  48.5  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  29.01 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  32.26 
 
 		 152 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  26.25 
 
 		 226 aa  47.4  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  23.57 
 
 		 323 aa  47.4  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  25.68 
 
 		 150 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  28 
 
 		 150 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  25 
 
 		 235 aa  45.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  29.45 
 
 		 222 aa  45.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3612  hypothetical protein  27.63 
 
 		 201 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  27.17 
 
 		 168 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  29.58 
 
 		 157 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  25.15 
 
 		 313 aa  44.7  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0347  hypothetical protein  33.64 
 
 		 158 aa  44.3  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.119312  normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  30 
 
 		 1345 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  23.61 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  27.27 
 
 		 240 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3026  hypothetical protein  48.84 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  33.62 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  30 
 
 		 1372 aa  43.9  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  22.98 
 
 		 258 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  25.18 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  24.14 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  25.18 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  26.67 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  24.84 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  30.77 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  25.31 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  24.18 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  27.27 
 
 		 221 aa  42  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  26.85 
 
 		 218 aa  41.6  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  29.46 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  27.08 
 
 		 151 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  27.93 
 
 		 231 aa  41.6  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  27.84 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  30.63 
 
 		 197 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  27.68 
 
 		 151 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  24.84 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  26.09 
 
 		 236 aa  40.8  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>