113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5411 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
218 aa  455  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  45.87 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  42.72 
 
 
212 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  42.16 
 
 
208 aa  159  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5035  protein of unknown function DUF1568  40.47 
 
 
214 aa  154  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.916294 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  34.18 
 
 
1372 aa  95.5  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  34.02 
 
 
1345 aa  95.5  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  29.53 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  33.04 
 
 
163 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  31.3 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  34.55 
 
 
149 aa  61.6  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  32.04 
 
 
150 aa  59.3  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  26.67 
 
 
151 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  28.24 
 
 
150 aa  55.5  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0220  hypothetical protein  37.38 
 
 
298 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0231  protein of unknown function DUF1568  34.58 
 
 
298 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0242  protein of unknown function DUF1568  34.58 
 
 
298 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  31.25 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  30.39 
 
 
152 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  31.48 
 
 
163 aa  52.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  31.9 
 
 
153 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  27.05 
 
 
184 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  28.95 
 
 
178 aa  52  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  30.36 
 
 
187 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  26.36 
 
 
163 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  25.86 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  29.13 
 
 
149 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  27.45 
 
 
152 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  29.41 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  32.46 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  29.91 
 
 
253 aa  49.3  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  27.03 
 
 
224 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  24.22 
 
 
150 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  26.02 
 
 
151 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  26.85 
 
 
205 aa  48.9  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  26.23 
 
 
151 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  29.31 
 
 
165 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  27.68 
 
 
133 aa  48.5  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  27.68 
 
 
184 aa  48.5  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  28.45 
 
 
191 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  27.19 
 
 
177 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  28.44 
 
 
188 aa  48.5  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2321  hypothetical protein  33.04 
 
 
297 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0102584 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  29.73 
 
 
153 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0309  hypothetical protein  30.77 
 
 
297 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  28.97 
 
 
253 aa  47.8  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  25.45 
 
 
176 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  26.83 
 
 
150 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  31.68 
 
 
235 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2161  hypothetical protein  31.03 
 
 
295 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3990  hypothetical protein  30.56 
 
 
320 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  26.09 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3026  hypothetical protein  44.19 
 
 
76 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247877  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  27.42 
 
 
151 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  39.58 
 
 
160 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4133  hypothetical protein  30.56 
 
 
298 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  28.95 
 
 
179 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  26.96 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26971  hypothetical protein  26.58 
 
 
260 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  26.02 
 
 
151 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  29.25 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  27.19 
 
 
258 aa  46.6  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27481  hypothetical protein  26.58 
 
 
260 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.581269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  32.04 
 
 
223 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  28.1 
 
 
177 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  23.01 
 
 
165 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0320  protein of unknown function DUF1568  31.62 
 
 
297 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  23.01 
 
 
165 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  24.58 
 
 
179 aa  45.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  30.1 
 
 
226 aa  45.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  28.04 
 
 
252 aa  45.8  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  24 
 
 
250 aa  45.8  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  24.35 
 
 
159 aa  45.8  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0331  protein of unknown function DUF1568  31.62 
 
 
297 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214506  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  23.01 
 
 
165 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  26.79 
 
 
161 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  32.46 
 
 
235 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  28.45 
 
 
186 aa  45.4  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  23.01 
 
 
165 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  27.27 
 
 
178 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  23.01 
 
 
165 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  28.57 
 
 
236 aa  45.1  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  27.52 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  28.45 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  27.52 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  27.19 
 
 
251 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  24.03 
 
 
179 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  27.52 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1541  hypothetical protein  29.52 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.463797  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  27.27 
 
 
161 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  27.68 
 
 
313 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  26.09 
 
 
310 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  30 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  24.56 
 
 
175 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  26.61 
 
 
230 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27031  hypothetical protein  25.95 
 
 
260 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  29.31 
 
 
191 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  26.67 
 
 
318 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  27.59 
 
 
185 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  28.95 
 
 
234 aa  42.4  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>