108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1962 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  344  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  58.54 
 
 
184 aa  205  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  56.1 
 
 
175 aa  204  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  56.44 
 
 
184 aa  201  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  53.99 
 
 
178 aa  193  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  57.59 
 
 
161 aa  190  9e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  52.47 
 
 
177 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  56.44 
 
 
175 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  54.94 
 
 
179 aa  187  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  51.55 
 
 
176 aa  186  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  50.62 
 
 
177 aa  183  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  52.1 
 
 
179 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  50 
 
 
176 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  49.38 
 
 
178 aa  177  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  49.69 
 
 
163 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  49.69 
 
 
178 aa  174  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  55.1 
 
 
161 aa  174  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  50 
 
 
178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  50.3 
 
 
180 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  49.69 
 
 
165 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  59.54 
 
 
133 aa  168  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  49.08 
 
 
165 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  49.08 
 
 
165 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  47.24 
 
 
176 aa  165  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  49.08 
 
 
165 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  48.47 
 
 
165 aa  164  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  48.77 
 
 
179 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  48.5 
 
 
187 aa  154  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  47.9 
 
 
187 aa  152  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  45.4 
 
 
159 aa  145  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  44.72 
 
 
179 aa  143  9e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  45.61 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  41.92 
 
 
191 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  43.29 
 
 
171 aa  137  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  42.17 
 
 
191 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  29.11 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2244  transposase  28.66 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196666  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  30.07 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  23.13 
 
 
163 aa  61.6  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  24.39 
 
 
188 aa  57.4  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  29.58 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888b  hypothetical protein  61.76 
 
 
101 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0301  hypothetical protein  61.76 
 
 
91 aa  55.8  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  26.53 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  44.64 
 
 
197 aa  54.7  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  27.21 
 
 
168 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  32.2 
 
 
169 aa  53.9  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  26.9 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  29.17 
 
 
186 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  25.33 
 
 
196 aa  51.2  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  28.57 
 
 
214 aa  51.2  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  31.78 
 
 
197 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  33.96 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  31.25 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  28.09 
 
 
192 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  25.33 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0347  hypothetical protein  30.63 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.119312  normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  24.84 
 
 
152 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  27.59 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  24.18 
 
 
179 aa  48.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  25.73 
 
 
187 aa  48.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3154  hypothetical protein  39.34 
 
 
58 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0787684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  27.27 
 
 
150 aa  47.4  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  26.21 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  21.77 
 
 
150 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  24.18 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  24.78 
 
 
232 aa  45.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3026  hypothetical protein  34.29 
 
 
76 aa  45.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247877  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  25.71 
 
 
163 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  25.71 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  31.18 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  30.3 
 
 
212 aa  44.3  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  25.51 
 
 
222 aa  44.3  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3612  hypothetical protein  31.78 
 
 
201 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368765  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  34.41 
 
 
197 aa  44.3  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  26.5 
 
 
226 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  25 
 
 
234 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  27.27 
 
 
236 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  29.24 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  27.03 
 
 
258 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33350  hypothetical protein  63.64 
 
 
38 aa  43.9  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  23.76 
 
 
235 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  27.97 
 
 
236 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  31.25 
 
 
223 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  24.56 
 
 
310 aa  43.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  23.85 
 
 
249 aa  43.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  25.71 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  27.21 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  26.26 
 
 
221 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1036  hypothetical protein  24.56 
 
 
222 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0902  hypothetical protein  25 
 
 
250 aa  42  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  25 
 
 
224 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  24.12 
 
 
197 aa  41.6  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  21.95 
 
 
177 aa  41.2  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2065  hypothetical protein  29.01 
 
 
184 aa  41.2  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  25 
 
 
203 aa  41.2  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0242  protein of unknown function DUF1568  22.88 
 
 
298 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>