73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1136 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  402  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  44.81 
 
 
221 aa  175  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  43.5 
 
 
224 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  43.68 
 
 
198 aa  166  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  45.59 
 
 
199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  38.91 
 
 
251 aa  156  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  41.8 
 
 
203 aa  156  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  42.78 
 
 
197 aa  155  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  41.62 
 
 
196 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  39.68 
 
 
203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  40.21 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  38.43 
 
 
232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  40.5 
 
 
201 aa  145  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  40 
 
 
204 aa  145  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  41.03 
 
 
198 aa  144  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  42.19 
 
 
177 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  44.32 
 
 
200 aa  144  8.000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  43.24 
 
 
174 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  41.71 
 
 
223 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  39.69 
 
 
197 aa  138  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  40.33 
 
 
193 aa  137  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  41 
 
 
220 aa  135  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  39.36 
 
 
249 aa  134  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  39.06 
 
 
193 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  41.21 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  36.36 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  36.76 
 
 
204 aa  131  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  37.3 
 
 
179 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  37.5 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  40.11 
 
 
163 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  40.11 
 
 
163 aa  124  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  37.02 
 
 
219 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  34.7 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  36.46 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  37.17 
 
 
207 aa  118  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  32.24 
 
 
258 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  34.72 
 
 
192 aa  104  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  58.97 
 
 
107 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  31.79 
 
 
200 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  52.17 
 
 
127 aa  98.2  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  30.05 
 
 
190 aa  90.5  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  37.04 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  36.78 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  25.97 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  25.47 
 
 
175 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  25.77 
 
 
179 aa  58.2  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  43.75 
 
 
165 aa  57  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  41.27 
 
 
172 aa  56.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  26.42 
 
 
176 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  25 
 
 
180 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  23.46 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  22.7 
 
 
179 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  22.64 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  21.38 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  22.36 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  28.09 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  21.38 
 
 
179 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  23.6 
 
 
178 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  25.3 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  25.16 
 
 
184 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  23.9 
 
 
178 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  24.69 
 
 
161 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  23.46 
 
 
191 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  20.37 
 
 
163 aa  44.7  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  21.97 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  25.31 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  24.54 
 
 
165 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  24.54 
 
 
165 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  24.54 
 
 
165 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  28.7 
 
 
133 aa  42.4  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5035  protein of unknown function DUF1568  25.69 
 
 
214 aa  41.6  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.916294 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  27.52 
 
 
208 aa  41.2  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  27.93 
 
 
214 aa  41.2  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>