77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1092 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  66.98 
 
 		 220 aa  263  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  69.27 
 
 		 197 aa  260  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  60 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  60.64 
 
 		 193 aa  211  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  57.87 
 
 		 201 aa  208  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  56.35 
 
 		 204 aa  198  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  47.74 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  49.47 
 
 		 196 aa  181  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  44.33 
 
 		 207 aa  168  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  46.89 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  48.55 
 
 		 177 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  46.55 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  45.11 
 
 		 203 aa  157  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  44.69 
 
 		 187 aa  155  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  41.94 
 
 		 174 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  44.57 
 
 		 203 aa  154  9e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  41.9 
 
 		 168 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  41.71 
 
 		 198 aa  146  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  41.95 
 
 		 163 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  45.81 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  42.11 
 
 		 163 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  42.05 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  43.01 
 
 		 193 aa  141  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  43.41 
 
 		 179 aa  141  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  43.23 
 
 		 199 aa  138  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  41.71 
 
 		 192 aa  138  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  40.09 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  41.03 
 
 		 197 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  40.29 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  41.46 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  43.93 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  41.18 
 
 		 200 aa  131  9e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  39.9 
 
 		 198 aa  124  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  37.44 
 
 		 251 aa  122  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  35.08 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  35.94 
 
 		 221 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  55.32 
 
 		 127 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  52.27 
 
 		 107 aa  96.7  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  34.85 
 
 		 200 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  45.28 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  31.51 
 
 		 153 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  38.64 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  25 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  40.58 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  32.63 
 
 		 1345 aa  55.1  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  32.63 
 
 		 1372 aa  54.7  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  39.13 
 
 		 165 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  25.64 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  32.76 
 
 		 129 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  29.94 
 
 		 171 aa  52  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  26.35 
 
 		 151 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  28.67 
 
 		 163 aa  52  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  25.77 
 
 		 163 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  26.37 
 
 		 150 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  24.22 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  26.71 
 
 		 152 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  32.98 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  23.97 
 
 		 152 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  26.03 
 
 		 150 aa  48.5  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  24.36 
 
 		 149 aa  48.5  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  24.67 
 
 		 150 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  25.95 
 
 		 151 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  24 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  26.8 
 
 		 179 aa  45.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  24.05 
 
 		 151 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  21.38 
 
 		 150 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  26.85 
 
 		 152 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  23.31 
 
 		 191 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  25.49 
 
 		 184 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  25.62 
 
 		 178 aa  43.1  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  28.42 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  23.17 
 
 		 151 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3026  hypothetical protein  47.22 
 
 		 76 aa  42  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  26.32 
 
 		 208 aa  42  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  23.6 
 
 		 191 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  27.91 
 
 		 178 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>