42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0555 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  267  4e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  96.85 
 
 
177 aa  259  6e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  52.03 
 
 
179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  57.14 
 
 
201 aa  118  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  50 
 
 
193 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  47.97 
 
 
193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  62.03 
 
 
198 aa  111  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  55.32 
 
 
223 aa  108  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  54.74 
 
 
197 aa  108  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  42.86 
 
 
196 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  49.04 
 
 
232 aa  103  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  51.22 
 
 
187 aa  101  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  38.46 
 
 
204 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  52.38 
 
 
204 aa  99.4  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  57.32 
 
 
220 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  50.57 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  49.43 
 
 
207 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  52.17 
 
 
192 aa  98.2  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  47.67 
 
 
224 aa  97.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  53.01 
 
 
200 aa  98.2  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  40.78 
 
 
206 aa  97.4  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  53.09 
 
 
198 aa  97.1  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  44.92 
 
 
163 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  44.92 
 
 
163 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  44.66 
 
 
203 aa  96.3  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  50.52 
 
 
199 aa  95.9  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  44.92 
 
 
168 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  44.92 
 
 
174 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  46.24 
 
 
239 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  43.88 
 
 
203 aa  93.6  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  46.81 
 
 
251 aa  93.6  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  42.14 
 
 
197 aa  93.2  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  49.43 
 
 
221 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  47.56 
 
 
219 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  47.56 
 
 
185 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  46.84 
 
 
192 aa  84  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  47.19 
 
 
258 aa  83.6  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  43.68 
 
 
152 aa  80.1  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  41.3 
 
 
249 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  30.23 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  36.89 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  41.43 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>