46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1035 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  473  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  54.02 
 
 
203 aa  232  3e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  54.02 
 
 
203 aa  232  3e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  44.67 
 
 
198 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  42.79 
 
 
251 aa  169  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  47.32 
 
 
221 aa  168  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  43.5 
 
 
192 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  41.43 
 
 
201 aa  149  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  37.88 
 
 
179 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  41.09 
 
 
197 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  37.56 
 
 
197 aa  141  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  40.3 
 
 
206 aa  139  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  40.19 
 
 
204 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  38.27 
 
 
196 aa  138  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  38.33 
 
 
232 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  37.56 
 
 
193 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  40.29 
 
 
223 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  37.75 
 
 
177 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  40.09 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  37.5 
 
 
197 aa  132  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  34.85 
 
 
174 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  36.04 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  34.38 
 
 
168 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  36.23 
 
 
200 aa  124  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  36.76 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  34.02 
 
 
198 aa  118  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  31.47 
 
 
163 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  35.85 
 
 
207 aa  118  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  31.47 
 
 
163 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  37.38 
 
 
220 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  32.71 
 
 
187 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  36.02 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  31.68 
 
 
193 aa  109  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  30.41 
 
 
219 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  30.41 
 
 
185 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  48.39 
 
 
107 aa  102  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  26.51 
 
 
258 aa  98.6  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  47.67 
 
 
127 aa  97.8  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  50.5 
 
 
129 aa  95.5  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  28.29 
 
 
192 aa  91.7  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  30.39 
 
 
200 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  28.42 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  34.67 
 
 
152 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  30.68 
 
 
165 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  32.91 
 
 
172 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1447  hypothetical protein  53.49 
 
 
148 aa  46.2  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.979821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>