59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1453 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  430  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  96.06 
 
 
203 aa  421  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  54.02 
 
 
224 aa  232  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  49.31 
 
 
239 aa  205  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  47.12 
 
 
204 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  46.39 
 
 
206 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  44.57 
 
 
223 aa  154  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  43.5 
 
 
196 aa  152  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  45.2 
 
 
193 aa  151  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  39.68 
 
 
192 aa  151  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  42.78 
 
 
201 aa  149  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  40.81 
 
 
232 aa  148  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  43.09 
 
 
179 aa  147  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  41.76 
 
 
219 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  41.21 
 
 
185 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  39.11 
 
 
174 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  40.68 
 
 
249 aa  142  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  41.71 
 
 
197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  36.96 
 
 
193 aa  137  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  40.45 
 
 
177 aa  137  7.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  38.73 
 
 
168 aa  137  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  40.98 
 
 
197 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  37.76 
 
 
198 aa  134  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  40.5 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  38.34 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  39.57 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  39.44 
 
 
187 aa  132  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  39.04 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  36.61 
 
 
198 aa  129  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  38.29 
 
 
163 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  38.29 
 
 
163 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  41.54 
 
 
204 aa  128  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  36.59 
 
 
221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  37.71 
 
 
200 aa  124  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  35.75 
 
 
251 aa  122  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  32.35 
 
 
200 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  33.88 
 
 
192 aa  108  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  52.44 
 
 
107 aa  95.1  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  43.88 
 
 
127 aa  93.6  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  30.59 
 
 
190 aa  89.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  39.02 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  37.97 
 
 
258 aa  74.7  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  23.08 
 
 
149 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  29.67 
 
 
165 aa  49.3  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  36.07 
 
 
172 aa  48.9  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  23.98 
 
 
176 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  24.55 
 
 
178 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  25.42 
 
 
150 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  26.05 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  25.44 
 
 
150 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  28.3 
 
 
1372 aa  43.5  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  28.3 
 
 
1345 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  25.16 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  41.03 
 
 
129 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3026  hypothetical protein  29.58 
 
 
76 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247877  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  25.89 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  23.86 
 
 
178 aa  42.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  22.03 
 
 
152 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  23.27 
 
 
184 aa  41.6  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.207714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>