59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1141 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  411  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  57.58 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  59.11 
 
 		 197 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  58.88 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  54.5 
 
 		 193 aa  211  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  55.66 
 
 		 220 aa  209  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  51.5 
 
 		 206 aa  204  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  48 
 
 		 196 aa  175  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  48.21 
 
 		 249 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  40.59 
 
 		 177 aa  159  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  43.84 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  42.92 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  43.13 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  42.29 
 
 		 198 aa  155  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  39.41 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  41.54 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  41.03 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  39.38 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  41.46 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  40.91 
 
 		 187 aa  145  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  39.38 
 
 		 185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  41.41 
 
 		 179 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  39.61 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  38.34 
 
 		 163 aa  141  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  38.34 
 
 		 163 aa  141  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  41.24 
 
 		 197 aa  141  7e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  40 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  38.78 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  38.54 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  38.07 
 
 		 174 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  38.86 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  37.84 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  41.03 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  38.42 
 
 		 168 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  39.6 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  34.34 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  36.27 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  31.45 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  53.41 
 
 		 127 aa  104  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  95.9  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  27.67 
 
 		 200 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  36.73 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  41.43 
 
 		 129 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  38.57 
 
 		 172 aa  52.4  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  37.68 
 
 		 165 aa  52.4  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  39.66 
 
 		 153 aa  51.6  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  35.09 
 
 		 1345 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  35.09 
 
 		 1372 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  38.6 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  38.18 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  36.21 
 
 		 150 aa  45.1  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  24.17 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  27.43 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  23.33 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  26.26 
 
 		 179 aa  42  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  32.31 
 
 		 153 aa  41.6  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  38.33 
 
 		 150 aa  41.6  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  22.03 
 
 		 191 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  37.29 
 
 		 151 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>