157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3919 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  310  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  63.58 
 
 		 151 aa  207  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  64.63 
 
 		 150 aa  206  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  62.91 
 
 		 151 aa  200  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  60 
 
 		 151 aa  183  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  63.57 
 
 		 184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  57.24 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  56.29 
 
 		 151 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  55.63 
 
 		 151 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  48 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  52.03 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  50.33 
 
 		 151 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  46.31 
 
 		 152 aa  154  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  44.59 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  46.62 
 
 		 150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  44.83 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  48.18 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  40.69 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  43.8 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  36.55 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  34.25 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  44.14 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16060  hypothetical protein  46.51 
 
 		 86 aa  89  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02923  hypothetical protein  31.06 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  30.82 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  26.24 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  30.82 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  30.46 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  30.28 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  26.32 
 
 		 241 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  25.56 
 
 		 322 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  26.32 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  30.71 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  29.01 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  29.8 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  28.15 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  29.08 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  32.99 
 
 		 1345 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  24.62 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  27.21 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  27.48 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  31.76 
 
 		 282 aa  55.1  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02732  hypothetical protein  37.33 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  25.68 
 
 		 288 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  31.96 
 
 		 1372 aa  53.9  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  25.66 
 
 		 288 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  27.34 
 
 		 205 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  25.18 
 
 		 338 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  29.79 
 
 		 236 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  26.81 
 
 		 335 aa  52.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  27.13 
 
 		 221 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  25 
 
 		 288 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  30.59 
 
 		 305 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  22.79 
 
 		 248 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  22.79 
 
 		 248 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  24.63 
 
 		 312 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  25.55 
 
 		 335 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  30.71 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  23.39 
 
 		 314 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  31.06 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  23.66 
 
 		 312 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  26.53 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  25 
 
 		 180 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  27.81 
 
 		 179 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  24.19 
 
 		 316 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  24.26 
 
 		 287 aa  50.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  28.44 
 
 		 258 aa  50.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  26.28 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  26.62 
 
 		 240 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  29.79 
 
 		 252 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  25.37 
 
 		 304 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  26.67 
 
 		 318 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  26.53 
 
 		 232 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  26.98 
 
 		 212 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5035  protein of unknown function DUF1568  30.91 
 
 		 214 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.916294 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  23.36 
 
 		 325 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  24.22 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  24.09 
 
 		 327 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  24.58 
 
 		 230 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  24.66 
 
 		 193 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  22.39 
 
 		 315 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  29.5 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  26.5 
 
 		 236 aa  47.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  27.48 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  27.42 
 
 		 218 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  27.27 
 
 		 326 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  24.58 
 
 		 230 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  24.58 
 
 		 230 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  28 
 
 		 236 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  24.44 
 
 		 319 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  26.71 
 
 		 239 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  31.58 
 
 		 231 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  25.69 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  25.76 
 
 		 323 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  26.15 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  23.24 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  29.1 
 
 		 234 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>