106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1888 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  360  7.0000000000000005e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  47.78 
 
 		 180 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  46.3 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  46.34 
 
 		 179 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  46.39 
 
 		 191 aa  158  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  42.94 
 
 		 179 aa  155  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  48.45 
 
 		 159 aa  154  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  46.34 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  46.39 
 
 		 191 aa  150  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  46.2 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  44.72 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  45.4 
 
 		 165 aa  148  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  46.2 
 
 		 165 aa  148  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  46.2 
 
 		 165 aa  148  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  46.99 
 
 		 187 aa  147  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  45.51 
 
 		 163 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  44.79 
 
 		 165 aa  147  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  42.29 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  43.64 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  40.74 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  41.46 
 
 		 177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  41.24 
 
 		 175 aa  144  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  43.35 
 
 		 176 aa  144  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  42.29 
 
 		 179 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  45.14 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  44.24 
 
 		 175 aa  142  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  45.18 
 
 		 191 aa  141  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  44.59 
 
 		 161 aa  140  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  45.14 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  43.37 
 
 		 177 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  43.29 
 
 		 164 aa  137  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  40.12 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  42.57 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  45.24 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  34.15 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  34.62 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2244  transposase  30.57 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196666  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  26.76 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  32.84 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  30.5 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  27.69 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  26.9 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  26.95 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  30.5 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  29.32 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  27.86 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  28.03 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  26.24 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  33.05 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  29.08 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  29.66 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  24.11 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  27.16 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  31.03 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  26.95 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  25.19 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  31.03 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  28.37 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  29.94 
 
 		 223 aa  52  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  26.02 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  27.27 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  29.25 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  25.98 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  29.29 
 
 		 163 aa  51.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  30.51 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  29.65 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  26.95 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  24.82 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  26 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  34.75 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  25.32 
 
 		 187 aa  48.1  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  25.37 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  23.38 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  26.9 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  27.52 
 
 		 1372 aa  47.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  21.99 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  22.56 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  28.3 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3612  hypothetical protein  42.31 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368765  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  23.74 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  27.92 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  28.26 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1717  hypothetical protein  26.39 
 
 		 295 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1788  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.239361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  24.81 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  23.81 
 
 		 232 aa  44.7  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  24.18 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  27.36 
 
 		 1345 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  23.65 
 
 		 251 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  25.32 
 
 		 226 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3368  transposase  26.62 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.863098  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  23.13 
 
 		 234 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  24.65 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  26.32 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  24.37 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  37.14 
 
 		 239 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  27.56 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  27.59 
 
 		 212 aa  42  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  25.87 
 
 		 160 aa  42  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  26.36 
 
 		 218 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>