39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2244 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2244  transposase  100 
 
 		 161 aa  315  1e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196666  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  30.38 
 
 		 180 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  38.06 
 
 		 179 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  37.18 
 
 		 178 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  35.4 
 
 		 176 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  34.73 
 
 		 184 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  35.44 
 
 		 179 aa  84.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  28.66 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  40.26 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  30.25 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  36.3 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  32.24 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  30.57 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  35.51 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  30.25 
 
 		 191 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  31.45 
 
 		 191 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  26.71 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  32.92 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  33.86 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  32.86 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  33.56 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  33.56 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  33.12 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  27.21 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  32.17 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  31.47 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  27.95 
 
 		 179 aa  72  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  26.71 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  28.03 
 
 		 133 aa  72  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  33.75 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  33.09 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  30.13 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  28.1 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  26.9 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  27.21 
 
 		 188 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  26.28 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>