34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1888b on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1888b  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  213  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0301  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  193  8.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  85.96 
 
 
184 aa  107  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  90.62 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  58.7 
 
 
175 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  58.7 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  65.71 
 
 
178 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  61.76 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  53.33 
 
 
178 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  45.65 
 
 
177 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  46.81 
 
 
175 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  53.19 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  47.83 
 
 
177 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  47.83 
 
 
178 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  45.65 
 
 
176 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  46.67 
 
 
178 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  54.29 
 
 
179 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  48.94 
 
 
179 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  37.78 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  43.1 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  50 
 
 
176 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  51.11 
 
 
163 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  50 
 
 
165 aa  47  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  52.78 
 
 
179 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  40.91 
 
 
165 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  40.91 
 
 
165 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  41.86 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  50 
 
 
180 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  47.22 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  42.5 
 
 
191 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  45.95 
 
 
179 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  44.9 
 
 
191 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33350  hypothetical protein  55.88 
 
 
38 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  43.4 
 
 
171 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>