277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1541 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1541  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.463797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2887  hypothetical protein  67.52 
 
 		 242 aa  340  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2563  protein of unknown function DUF1568  42.91 
 
 		 248 aa  205  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2564  hypothetical protein  41.83 
 
 		 170 aa  121  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1914  protein of unknown function DUF1568  45.9 
 
 		 124 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  30.17 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  41.18 
 
 		 234 aa  105  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  30.08 
 
 		 240 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  30.45 
 
 		 232 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  28.27 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  29.83 
 
 		 312 aa  99  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  28.45 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  30.14 
 
 		 239 aa  93.2  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  30.85 
 
 		 314 aa  93.2  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  34.51 
 
 		 235 aa  92.4  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  29.17 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  34.09 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  31.69 
 
 		 231 aa  89  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  28.31 
 
 		 316 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  27.88 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  32.33 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  30.77 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  27.27 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  29.58 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  26.43 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  26.43 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  27.31 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  32.12 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  26.58 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  33.1 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  26.24 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  24.27 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  35.77 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  27 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  26.43 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  26.64 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  28.97 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  23.85 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03381  hypothetical protein  34.85 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.593355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  26.2 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2620  hypothetical protein  32.58 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000852823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  24.65 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  25.76 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  30.99 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  27.7 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  27.7 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  26.76 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0179  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  25.11 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  26.01 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0902  hypothetical protein  24.08 
 
 		 250 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  24.85 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  31.06 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27481  hypothetical protein  34.85 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.581269 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  26.05 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3485  hypothetical protein  30.95 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  27.01 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  31.88 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  24.65 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  29.2 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  28.44 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  30.22 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  27.21 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  30.28 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  28.47 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  26.63 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  22.07 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  29.58 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  30.28 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  27.05 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13701  hypothetical protein  33.08 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  30.43 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26971  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2321  hypothetical protein  33.82 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0102584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  28.87 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  28.87 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  28.87 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  28.87 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  28.87 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27031  hypothetical protein  32.58 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  28.87 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  29.58 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  33.59 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29611  hypothetical protein  31.4 
 
 		 124 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  28.99 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  27.54 
 
 		 327 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0231  protein of unknown function DUF1568  23.08 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  26.6 
 
 		 190 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  28.87 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  28.87 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  28.87 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  28.87 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0309  hypothetical protein  31.62 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  28.87 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  28.87 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  28.87 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  28.87 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  26.06 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0331  protein of unknown function DUF1568  32.35 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2161  hypothetical protein  30.88 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>