More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2148 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2148  OmpA family protein  100 
 
 		 449 aa  918    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1992  OmpA family protein  38.21 
 
 		 452 aa  90.9  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0400  hypothetical protein  25.69 
 
 		 282 aa  88.6  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000382173  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0664  OmpA family protein  40.54 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  26.29 
 
 		 673 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3080  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.33 
 
 		 164 aa  68.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.430069  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  32.43 
 
 		 670 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  30.08 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  35.51 
 
 		 510 aa  67.8  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0166  outer membrane protein  36.03 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.00000251443  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  34.68 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 223 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  36.07 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  33.64 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  35.51 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  37.63 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  34.55 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  32.74 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  42.47 
 
 		 707 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  33.68 
 
 		 727 aa  63.5  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  41.33 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  38.16 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  30.71 
 
 		 620 aa  63.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  32.54 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.92 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.08 
 
 		 170 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1815  OmpA/MotB  34.95 
 
 		 165 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336374  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.08 
 
 		 170 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4748  OmpA/MotB  34.95 
 
 		 166 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  34.62 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  31.48 
 
 		 239 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  37.35 
 
 		 656 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  34.51 
 
 		 344 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 		 202 aa  62.4  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.71 
 
 		 170 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  33.06 
 
 		 209 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  34.51 
 
 		 344 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  32.43 
 
 		 217 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  36 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  31.25 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  34.51 
 
 		 344 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  29.03 
 
 		 1026 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0605  OmpA/MotB domain protein  31.39 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  32.52 
 
 		 537 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  33.63 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.58 
 
 		 164 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  31.3 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  32.23 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.43 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  38.55 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  36.44 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  27.46 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  39.47 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  31.37 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  31.53 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  32.23 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  33.63 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  31.13 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  32.11 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  33.03 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0036  hypothetical protein  22.07 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000461635  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  34.67 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  33.03 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  32.04 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  33.03 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  36.21 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  31.58 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  36.21 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  33.33 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1314  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.98 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 		 458 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  37.21 
 
 		 214 aa  59.3  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  33.33 
 
 		 319 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  29.73 
 
 		 694 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  30.77 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  32.04 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6878  Outer membrane lipoprotein omp16 precursor (peptidoglycan-associated lipoprotein)  33.01 
 
 		 149 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.401181  normal  0.0290754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 		 225 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  33.96 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  39.13 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  30.77 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  28.35 
 
 		 216 aa  58.9  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  32.43 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4144  OmpA/MotB  33.98 
 
 		 165 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  33.63 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  30.77 
 
 		 710 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  31.71 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  30.93 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  31.03 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  34.29 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  35.48 
 
 		 165 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  45.33 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>