More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3442 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3295  Fmu (Sun) domain-containing protein  70.28 
 
 		 459 aa  669    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3442  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 		 460 aa  953    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2960  Fmu (Sun) domain-containing protein  60.99 
 
 		 449 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2739  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.07 
 
 		 475 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438417  hitchhiker  0.0000842018 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1392  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.66 
 
 		 453 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1415  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.2 
 
 		 453 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2967  Fmu (Sun) domain protein  55.2 
 
 		 463 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.30363  normal  0.0477993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1209  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.92 
 
 		 458 aa  512  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207524  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1376  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.2 
 
 		 453 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1305  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.43 
 
 		 463 aa  509  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.88 
 
 		 457 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.972179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1575  NOL1/NOP2/sun family putative RNA methylase  54.5 
 
 		 486 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2697  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.43 
 
 		 457 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2867  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.48 
 
 		 469 aa  502  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2643  Fmu (Sun)  55.68 
 
 		 464 aa  482  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1086  Fmu (Sun)  48.12 
 
 		 454 aa  428  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.694942 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3846  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.81 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  29.91 
 
 		 416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.81 
 
 		 478 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  30.37 
 
 		 410 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  29.12 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  30.32 
 
 		 447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  30.14 
 
 		 466 aa  162  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.85 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  29.16 
 
 		 465 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  29.02 
 
 		 465 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  28.7 
 
 		 420 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  29.12 
 
 		 412 aa  159  8e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  29.21 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  28.94 
 
 		 420 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  28.94 
 
 		 420 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  28.94 
 
 		 420 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  28.92 
 
 		 519 aa  157  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  28.94 
 
 		 420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  28.94 
 
 		 420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  28.94 
 
 		 420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  29.86 
 
 		 421 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  28.94 
 
 		 420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.47 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.47 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  28.84 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.93 
 
 		 421 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.63 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.38 
 
 		 421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  28.38 
 
 		 421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.38 
 
 		 421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  30.12 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  30.37 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  27.77 
 
 		 434 aa  151  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  29.44 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  28.6 
 
 		 419 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.25 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0995  Fmu (Sun) domain protein  29.21 
 
 		 387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.788221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.5 
 
 		 418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  29 
 
 		 424 aa  145  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0406  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.95 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2091  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.21 
 
 		 425 aa  144  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605198 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0186  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase (sun family protein)  28.67 
 
 		 416 aa  143  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216651  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  27.9 
 
 		 403 aa  142  9e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.22 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  27.08 
 
 		 428 aa  140  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  33.96 
 
 		 460 aa  139  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  27.77 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.54 
 
 		 470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  27.31 
 
 		 419 aa  137  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  30.97 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  33.09 
 
 		 432 aa  136  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  32.53 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  30.84 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.11 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  37.61 
 
 		 428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  30.33 
 
 		 444 aa  133  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  26 
 
 		 425 aa  133  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  26 
 
 		 425 aa  133  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  35.32 
 
 		 425 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  31.73 
 
 		 430 aa  132  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  26.78 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  28.77 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  31.61 
 
 		 434 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  32.54 
 
 		 449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  26.27 
 
 		 433 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.78 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.76 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  29.63 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  28.91 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  30.65 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  28.95 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46635  predicted protein  33.19 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.247444  decreased coverage  0.000750659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  27.72 
 
 		 433 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  30.04 
 
 		 448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.66 
 
 		 404 aa  127  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  27.55 
 
 		 417 aa  126  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  29.47 
 
 		 428 aa  126  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  30.32 
 
 		 429 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  28.7 
 
 		 452 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  35.45 
 
 		 427 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  29.03 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  28.04 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  30.13 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  28.32 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>