More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2598 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  100 
 
 		 415 aa  831    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  57 
 
 		 423 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  58.97 
 
 		 447 aa  434  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  53.01 
 
 		 416 aa  433  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  57.46 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  56.39 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  56.72 
 
 		 420 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  56.72 
 
 		 420 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  56.72 
 
 		 420 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  56.72 
 
 		 420 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  56.72 
 
 		 420 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  56.4 
 
 		 421 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  56.72 
 
 		 420 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  56.72 
 
 		 420 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  54.22 
 
 		 420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.22 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  55.47 
 
 		 419 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.22 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  54.5 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.57 
 
 		 421 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  54.57 
 
 		 421 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.57 
 
 		 421 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  54.15 
 
 		 465 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  54.15 
 
 		 465 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.81 
 
 		 421 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.86 
 
 		 425 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  52.86 
 
 		 425 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  55.22 
 
 		 419 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.32 
 
 		 418 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  54.31 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.21 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.92 
 
 		 470 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  52.03 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.78 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  52.66 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  52.51 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.33 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.36 
 
 		 423 aa  358  9e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  49.53 
 
 		 429 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  48.1 
 
 		 519 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.29 
 
 		 465 aa  343  4e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  43.32 
 
 		 434 aa  299  6e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.48 
 
 		 478 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.26 
 
 		 426 aa  263  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.19 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  41.4 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  38.84 
 
 		 454 aa  243  7e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3160  Fmu (Sun) domain protein  40.32 
 
 		 449 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2934  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.63 
 
 		 459 aa  237  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144435 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.86 
 
 		 437 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  38.43 
 
 		 427 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.33 
 
 		 433 aa  229  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.75 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  37.82 
 
 		 433 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  36.08 
 
 		 430 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0966  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.01 
 
 		 437 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.13 
 
 		 430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  36.74 
 
 		 434 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  36.34 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3116  Fmu (Sun) domain protein  41.76 
 
 		 367 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  35.03 
 
 		 433 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  34.57 
 
 		 410 aa  209  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  36.51 
 
 		 427 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.02 
 
 		 429 aa  209  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0287  Fmu (Sun) domain protein  37.77 
 
 		 436 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  34.11 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  35.2 
 
 		 429 aa  202  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  35.73 
 
 		 434 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  35.73 
 
 		 429 aa  202  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  35.27 
 
 		 432 aa  202  8e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.71 
 
 		 429 aa  201  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1178  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.33 
 
 		 437 aa  199  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0995353  normal  0.6994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0087  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.95 
 
 		 370 aa  199  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  33.88 
 
 		 428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0298  Fmu (Sun) domain protein  39.05 
 
 		 437 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583508  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.41 
 
 		 405 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  33.97 
 
 		 412 aa  196  7e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0276  methyltransferase  37.81 
 
 		 437 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.398317  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.82 
 
 		 423 aa  193  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  34.49 
 
 		 433 aa  192  8e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  34.06 
 
 		 448 aa  192  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0406  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.2 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  33.16 
 
 		 443 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2178  Fmu (Sun) domain protein  34.04 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  32.62 
 
 		 460 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  30 
 
 		 404 aa  183  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.26 
 
 		 442 aa  182  7e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  31.07 
 
 		 403 aa  181  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  29.79 
 
 		 442 aa  180  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.83 
 
 		 404 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0186  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase (sun family protein)  31.62 
 
 		 416 aa  179  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2390  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.65 
 
 		 419 aa  179  9e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  31.71 
 
 		 448 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1799  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.99 
 
 		 404 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  32.72 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  30.34 
 
 		 448 aa  177  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2041  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.34 
 
 		 404 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  32.61 
 
 		 429 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  30.34 
 
 		 448 aa  176  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2212  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.34 
 
 		 404 aa  176  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369517  hitchhiker  0.00133347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>