More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0087 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0087  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 
370 aa  715    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  68.58 
 
 
427 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2934  Fmu (Sun) domain-containing protein  70.46 
 
 
459 aa  481  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3160  Fmu (Sun) domain protein  70.46 
 
 
449 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210419  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3116  Fmu (Sun) domain protein  70.73 
 
 
367 aa  480  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0966  Fmu (Sun) domain-containing protein  69.67 
 
 
437 aa  461  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  51.34 
 
 
433 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  51.07 
 
 
434 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.6 
 
 
433 aa  352  5.9999999999999994e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  51.08 
 
 
432 aa  352  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  53.74 
 
 
433 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  52.2 
 
 
430 aa  341  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  50.4 
 
 
432 aa  341  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  51.08 
 
 
434 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  50.13 
 
 
433 aa  334  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.94 
 
 
430 aa  328  8e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  44.2 
 
 
429 aa  278  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  44.2 
 
 
429 aa  278  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  41.42 
 
 
427 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.05 
 
 
429 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  41.51 
 
 
428 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.79 
 
 
429 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.33 
 
 
423 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1178  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.73 
 
 
437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0995353  normal  0.6994 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.42 
 
 
433 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  38.95 
 
 
429 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  40.85 
 
 
454 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  38.93 
 
 
429 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.95 
 
 
426 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  34.95 
 
 
428 aa  228  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  42.86 
 
 
420 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.64 
 
 
419 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  44.11 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  44.11 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  44.11 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  43.29 
 
 
419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  44.11 
 
 
420 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  44.11 
 
 
420 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  44.11 
 
 
420 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  44.11 
 
 
420 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.22 
 
 
478 aa  215  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  41.24 
 
 
420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  40.72 
 
 
395 aa  211  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  35.87 
 
 
416 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  46.1 
 
 
419 aa  209  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.88 
 
 
465 aa  208  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.16 
 
 
420 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.16 
 
 
420 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0406  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.02 
 
 
389 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  41.25 
 
 
519 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  40.16 
 
 
447 aa  206  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.11 
 
 
418 aa  206  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.1 
 
 
421 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  43.81 
 
 
425 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  42.43 
 
 
421 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.67 
 
 
417 aa  202  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  43.17 
 
 
466 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  45.39 
 
 
421 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.39 
 
 
421 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.39 
 
 
421 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  40.82 
 
 
417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  41.84 
 
 
429 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  41.16 
 
 
465 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  41.16 
 
 
465 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  39.95 
 
 
415 aa  199  6e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  40.51 
 
 
423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.4 
 
 
470 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  39.24 
 
 
429 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  41.82 
 
 
419 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  38.51 
 
 
434 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  39.24 
 
 
417 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  34.7 
 
 
423 aa  194  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.22 
 
 
425 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  39.22 
 
 
425 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.03 
 
 
423 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.33 
 
 
424 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0455  NOL1/NOP2/sun family protein  37.87 
 
 
387 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2108  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.97 
 
 
387 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1028  Fmu (Sun)  38.11 
 
 
396 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1645  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase  37.67 
 
 
392 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000605846 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1227  Fmu (Sun)  35.51 
 
 
391 aa  175  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2376  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.75 
 
 
399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.194397 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.07 
 
 
404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0287  Fmu (Sun) domain protein  42.95 
 
 
436 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  33.12 
 
 
410 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.91 
 
 
437 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  38.51 
 
 
460 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0276  methyltransferase  47.67 
 
 
437 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.398317  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0298  Fmu (Sun) domain protein  47.64 
 
 
437 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583508  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  32.8 
 
 
403 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  33.55 
 
 
412 aa  150  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1983  Fmu (Sun)  38.36 
 
 
387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100051  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.44 
 
 
404 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  34.82 
 
 
449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  36.93 
 
 
448 aa  146  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  36.81 
 
 
452 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.67 
 
 
405 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  34.64 
 
 
451 aa  143  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2178  Fmu (Sun) domain protein  35.08 
 
 
430 aa  142  9e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1267  Fmu (Sun) domain protein  34.29 
 
 
460 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>