More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0406 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0406  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 		 389 aa  750    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  51.15 
 
 		 395 aa  347  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1028  Fmu (Sun)  52.67 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  41.95 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.78 
 
 		 433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  39.32 
 
 		 432 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.29 
 
 		 426 aa  242  7e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  38.64 
 
 		 433 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.19 
 
 		 430 aa  239  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  39.09 
 
 		 434 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.73 
 
 		 433 aa  236  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  38.79 
 
 		 432 aa  234  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3160  Fmu (Sun) domain protein  41.8 
 
 		 449 aa  232  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2934  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.34 
 
 		 459 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  41.28 
 
 		 430 aa  226  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  41.69 
 
 		 427 aa  225  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  39.36 
 
 		 433 aa  223  6e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  38.26 
 
 		 434 aa  222  9e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  39.13 
 
 		 433 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0966  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.33 
 
 		 437 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  37.77 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  40.18 
 
 		 429 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0087  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.84 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.48 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  36.2 
 
 		 429 aa  200  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  36.2 
 
 		 429 aa  201  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.45 
 
 		 429 aa  199  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3116  Fmu (Sun) domain protein  41.16 
 
 		 367 aa  199  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1645  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase  39.63 
 
 		 392 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000605846 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1983  Fmu (Sun)  38.31 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100051  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  36.57 
 
 		 420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  36.5 
 
 		 416 aa  197  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  35.67 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1227  Fmu (Sun)  35.75 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2108  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.78 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  37.5 
 
 		 425 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  39.39 
 
 		 447 aa  193  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0455  NOL1/NOP2/sun family protein  40.29 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1178  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.48 
 
 		 437 aa  192  6e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0995353  normal  0.6994 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2376  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.95 
 
 		 399 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.194397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.08 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.89 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  35.93 
 
 		 419 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  35.76 
 
 		 466 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.58 
 
 		 437 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  35.35 
 
 		 415 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  33.84 
 
 		 423 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.55 
 
 		 423 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  35.71 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.04 
 
 		 470 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  34.81 
 
 		 419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  38.12 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  35.93 
 
 		 420 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  35.93 
 
 		 420 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.68 
 
 		 419 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  35.93 
 
 		 420 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.04 
 
 		 465 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  37.01 
 
 		 427 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  35.93 
 
 		 420 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  35.93 
 
 		 420 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  35.93 
 
 		 420 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  35.93 
 
 		 420 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.66 
 
 		 421 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  35.66 
 
 		 421 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.66 
 
 		 421 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  36.8 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  34.72 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  36.29 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.72 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  33.65 
 
 		 465 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  33.01 
 
 		 417 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  40 
 
 		 405 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.29 
 
 		 420 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.29 
 
 		 420 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.82 
 
 		 421 aa  179  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  31.95 
 
 		 428 aa  178  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  34.13 
 
 		 519 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  37.11 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  33.98 
 
 		 465 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.91 
 
 		 404 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  33.88 
 
 		 429 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.92 
 
 		 404 aa  176  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.63 
 
 		 429 aa  176  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.08 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  31.18 
 
 		 410 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2390  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.01 
 
 		 419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  34.89 
 
 		 423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2178  Fmu (Sun) domain protein  42.44 
 
 		 430 aa  172  9e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.5 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.77 
 
 		 418 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  37.87 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2212  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.59 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369517  hitchhiker  0.00133347 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  31.46 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1799  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.05 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2309  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.07 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  39.1 
 
 		 448 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2131  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.61 
 
 		 404 aa  169  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.547964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2207  Fmu (Sun) domain-containing protein  41 
 
 		 404 aa  169  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2041  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.32 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2215  sun protein, putative  39.56 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>