More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1921 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 
430 aa  855    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  65.27 
 
 
430 aa  550  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  58 
 
 
433 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  58 
 
 
427 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  55.68 
 
 
433 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  56.12 
 
 
434 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  56.68 
 
 
433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  54.94 
 
 
432 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  54.86 
 
 
432 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  56.61 
 
 
434 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  54.86 
 
 
433 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3160  Fmu (Sun) domain protein  54.15 
 
 
449 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210419  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2934  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.69 
 
 
459 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0966  Fmu (Sun) domain-containing protein  57.37 
 
 
437 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  50.59 
 
 
428 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1178  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.68 
 
 
437 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0995353  normal  0.6994 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.19 
 
 
429 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  50.59 
 
 
427 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.65 
 
 
423 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.91 
 
 
429 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  47.69 
 
 
429 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  47.45 
 
 
429 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  48.61 
 
 
429 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  48.72 
 
 
429 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  42.69 
 
 
428 aa  349  5e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3116  Fmu (Sun) domain protein  49.46 
 
 
367 aa  329  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.77 
 
 
433 aa  327  4.0000000000000003e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0087  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.94 
 
 
370 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  44.32 
 
 
454 aa  292  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.77 
 
 
426 aa  278  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.98 
 
 
478 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  43.69 
 
 
429 aa  263  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  36.89 
 
 
423 aa  248  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  40.05 
 
 
434 aa  246  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  37.29 
 
 
416 aa  244  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.41 
 
 
417 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0406  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.73 
 
 
389 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.09 
 
 
425 aa  235  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  39.09 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.25 
 
 
470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.23 
 
 
424 aa  233  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1645  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase  40.46 
 
 
392 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000605846 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  37.95 
 
 
417 aa  230  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  38 
 
 
423 aa  229  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1227  Fmu (Sun)  38.81 
 
 
391 aa  229  8e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  40.32 
 
 
419 aa  227  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.98 
 
 
418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  40.74 
 
 
447 aa  226  8e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  38.15 
 
 
420 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.13 
 
 
423 aa  222  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  43.57 
 
 
417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0455  NOL1/NOP2/sun family protein  41.57 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  38 
 
 
420 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  38.44 
 
 
395 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  38.26 
 
 
419 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  37.79 
 
 
425 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  37.3 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  37.3 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  37.3 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  37.3 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  37.3 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  37.3 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  37.3 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.92 
 
 
419 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1028  Fmu (Sun)  39.22 
 
 
396 aa  217  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  38.26 
 
 
419 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  38.13 
 
 
465 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2376  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.44 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.194397 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  37.67 
 
 
465 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2108  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.78 
 
 
387 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  36.51 
 
 
415 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  36.92 
 
 
421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.67 
 
 
421 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  37.67 
 
 
421 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.67 
 
 
421 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.67 
 
 
465 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  36.77 
 
 
429 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.7 
 
 
421 aa  207  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  35.39 
 
 
519 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  43.63 
 
 
466 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.28 
 
 
420 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.28 
 
 
420 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1983  Fmu (Sun)  39.12 
 
 
387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100051  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.59 
 
 
437 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0287  Fmu (Sun) domain protein  43.17 
 
 
436 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.81 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0594  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.37 
 
 
383 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0276  methyltransferase  43.95 
 
 
437 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.398317  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0298  Fmu (Sun) domain protein  42.99 
 
 
437 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  32.75 
 
 
448 aa  176  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  31.41 
 
 
410 aa  172  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  38.51 
 
 
460 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0186  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase (sun family protein)  32.31 
 
 
416 aa  171  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216651  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  32.49 
 
 
403 aa  170  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.04 
 
 
404 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  37.38 
 
 
464 aa  169  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  32.37 
 
 
446 aa  167  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2212  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.65 
 
 
404 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369517  hitchhiker  0.00133347 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  31.57 
 
 
412 aa  163  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.97 
 
 
405 aa  163  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>