More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2620 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  100 
 
 
423 aa  860    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  57 
 
 
415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  54.9 
 
 
416 aa  442  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  55.26 
 
 
447 aa  434  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  53.06 
 
 
421 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  54.03 
 
 
421 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.03 
 
 
421 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.03 
 
 
421 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.96 
 
 
420 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.96 
 
 
420 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  53.11 
 
 
420 aa  411  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  51.34 
 
 
417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.06 
 
 
421 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  51.67 
 
 
420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  51.2 
 
 
420 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  51.2 
 
 
420 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  51.2 
 
 
420 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  51.2 
 
 
419 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  51.2 
 
 
420 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  51.2 
 
 
420 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  51.44 
 
 
419 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  51.2 
 
 
420 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  51.2 
 
 
420 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  51.09 
 
 
465 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.44 
 
 
419 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.59 
 
 
418 aa  395  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  51.09 
 
 
465 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.32 
 
 
424 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  51.69 
 
 
466 aa  395  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  50.72 
 
 
425 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.76 
 
 
425 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  50 
 
 
425 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  50.24 
 
 
423 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  50.36 
 
 
419 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.59 
 
 
465 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  46.44 
 
 
519 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  50.36 
 
 
417 aa  364  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.59 
 
 
470 aa  361  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.72 
 
 
417 aa  356  5e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.4 
 
 
423 aa  355  6.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  46.9 
 
 
429 aa  355  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  42.35 
 
 
434 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.28 
 
 
478 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.36 
 
 
433 aa  252  7e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.7 
 
 
426 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  40.78 
 
 
429 aa  247  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  35.99 
 
 
432 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  38.19 
 
 
427 aa  245  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  36.64 
 
 
454 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  35.47 
 
 
433 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  36.45 
 
 
427 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.66 
 
 
429 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.66 
 
 
430 aa  239  8e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.59 
 
 
404 aa  236  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  35.4 
 
 
432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.86 
 
 
433 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  35.62 
 
 
434 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  35.78 
 
 
433 aa  229  9e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  34.57 
 
 
430 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  33.33 
 
 
412 aa  227  3e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  35.62 
 
 
433 aa  227  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  34.02 
 
 
429 aa  223  6e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  34.92 
 
 
434 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3160  Fmu (Sun) domain protein  38.02 
 
 
449 aa  222  9e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210419  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0966  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.63 
 
 
437 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.19 
 
 
437 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  33.87 
 
 
429 aa  222  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  33.1 
 
 
428 aa  219  7e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2934  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.33 
 
 
459 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144435 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.15 
 
 
429 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  34.64 
 
 
448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  34.4 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  32.6 
 
 
460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  31.52 
 
 
429 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0186  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase (sun family protein)  34.03 
 
 
416 aa  206  7e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216651  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.11 
 
 
404 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.01 
 
 
423 aa  202  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1178  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.88 
 
 
437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0995353  normal  0.6994 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  32.04 
 
 
451 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  31.04 
 
 
429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  30.31 
 
 
449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  32.94 
 
 
403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  32.04 
 
 
451 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  32.53 
 
 
453 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.94 
 
 
404 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2178  Fmu (Sun) domain protein  34.28 
 
 
430 aa  194  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  31.99 
 
 
410 aa  193  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3116  Fmu (Sun) domain protein  37.7 
 
 
367 aa  193  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  32.33 
 
 
451 aa  193  6e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  36.96 
 
 
464 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  34.64 
 
 
446 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0287  Fmu (Sun) domain protein  35.16 
 
 
436 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.97 
 
 
405 aa  190  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0087  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.7 
 
 
370 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  29.33 
 
 
452 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  28.03 
 
 
455 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  37.01 
 
 
468 aa  186  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  37.05 
 
 
448 aa  186  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0298  Fmu (Sun) domain protein  34.41 
 
 
437 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583508  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0406  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.16 
 
 
389 aa  186  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0517555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>