More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0941 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 
478 aa  969    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.8 
 
 
426 aa  378  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  46.2 
 
 
429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  43.04 
 
 
454 aa  349  5e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.9 
 
 
433 aa  309  9e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.16 
 
 
470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.51 
 
 
418 aa  303  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  42.16 
 
 
419 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.08 
 
 
421 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  43.08 
 
 
421 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.08 
 
 
421 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  52.9 
 
 
420 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  42.64 
 
 
421 aa  299  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  52.9 
 
 
420 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  52.9 
 
 
420 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  52.9 
 
 
420 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  52.58 
 
 
420 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  52.58 
 
 
420 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  52.58 
 
 
420 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  52.26 
 
 
420 aa  295  8e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.86 
 
 
421 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  41.72 
 
 
419 aa  294  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.42 
 
 
417 aa  290  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  40.51 
 
 
433 aa  289  9e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  41.32 
 
 
447 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.61 
 
 
420 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  39.53 
 
 
434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.61 
 
 
420 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.09 
 
 
424 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  41.16 
 
 
425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  40.56 
 
 
417 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  40.59 
 
 
466 aa  283  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  38.69 
 
 
433 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.37 
 
 
419 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  39.92 
 
 
434 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  40.47 
 
 
419 aa  280  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  40.48 
 
 
415 aa  279  6e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.53 
 
 
425 aa  279  9e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  39.53 
 
 
425 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  38.82 
 
 
432 aa  277  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  39.32 
 
 
423 aa  276  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  39.14 
 
 
416 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  38.9 
 
 
429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  39.95 
 
 
420 aa  273  5.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.31 
 
 
465 aa  271  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  37.28 
 
 
423 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  39.22 
 
 
519 aa  269  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.28 
 
 
423 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  48.08 
 
 
417 aa  267  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  49.83 
 
 
465 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  49.83 
 
 
465 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.98 
 
 
430 aa  265  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  38.61 
 
 
433 aa  263  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  39.74 
 
 
427 aa  259  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  37.5 
 
 
430 aa  259  8e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.53 
 
 
433 aa  256  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  35.73 
 
 
432 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  36.42 
 
 
428 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3160  Fmu (Sun) domain protein  37.76 
 
 
449 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210419  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2934  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.55 
 
 
459 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144435 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.67 
 
 
429 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  35.97 
 
 
427 aa  242  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  34.83 
 
 
428 aa  241  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0966  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.06 
 
 
437 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  35.79 
 
 
429 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  35.37 
 
 
429 aa  237  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1178  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.94 
 
 
437 aa  237  4e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0995353  normal  0.6994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  44.09 
 
 
434 aa  234  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  35.82 
 
 
429 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.02 
 
 
429 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  35.82 
 
 
429 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.39 
 
 
405 aa  220  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  34.76 
 
 
395 aa  220  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3116  Fmu (Sun) domain protein  41.19 
 
 
367 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  43.39 
 
 
416 aa  217  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.73 
 
 
404 aa  217  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2390  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.71 
 
 
419 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416115  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.67 
 
 
418 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1799  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.37 
 
 
404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2297  Fmu (Sun) domain protein  43.05 
 
 
404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000974746  normal  0.583601 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4571  hypothetical protein  43.05 
 
 
404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2285  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.05 
 
 
404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2309  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.71 
 
 
404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.06 
 
 
404 aa  214  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2131  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.37 
 
 
404 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.547964  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.2 
 
 
423 aa  213  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2207  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.37 
 
 
404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2088  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.71 
 
 
404 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2041  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.71 
 
 
404 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2215  sun protein, putative  42.37 
 
 
404 aa  213  9e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1739  Fmu (Sun)  43.73 
 
 
404 aa  210  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33576  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  38.31 
 
 
403 aa  210  5e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2212  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.69 
 
 
404 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369517  hitchhiker  0.00133347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0087  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.22 
 
 
370 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  40.97 
 
 
448 aa  206  9e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.75 
 
 
404 aa  206  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  39.13 
 
 
451 aa  203  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  33.19 
 
 
449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2178  Fmu (Sun) domain protein  43.38 
 
 
430 aa  201  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0406  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.48 
 
 
389 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0517555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>