More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4571 on replicon NC_009035
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1799  Fmu (Sun) domain-containing protein  93.81 
 
 
404 aa  783    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2215  sun protein, putative  87.38 
 
 
404 aa  738    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2088  Fmu (Sun) domain-containing protein  99.75 
 
 
404 aa  829    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2297  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 
404 aa  830    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000974746  normal  0.583601 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2390  Fmu (Sun) domain-containing protein  78.22 
 
 
419 aa  654    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416115  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  77.48 
 
 
405 aa  649    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2309  Fmu (Sun) domain-containing protein  89.11 
 
 
404 aa  752    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1739  Fmu (Sun)  75.74 
 
 
404 aa  638    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33576  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  75.74 
 
 
416 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2285  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 
404 aa  830    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2131  Fmu (Sun) domain-containing protein  89.11 
 
 
404 aa  751    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.547964  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2207  Fmu (Sun) domain-containing protein  89.36 
 
 
404 aa  752    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2041  Fmu (Sun) domain-containing protein  99.75 
 
 
404 aa  828    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4571  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  830    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2212  Fmu (Sun) domain-containing protein  77.72 
 
 
404 aa  651    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369517  hitchhiker  0.00133347 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  73.76 
 
 
404 aa  630  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  72.28 
 
 
418 aa  610  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  44.5 
 
 
403 aa  313  4.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.97 
 
 
404 aa  290  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  41.33 
 
 
412 aa  276  5e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  41.24 
 
 
410 aa  253  5.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0186  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase (sun family protein)  39.72 
 
 
416 aa  238  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216651  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  40.88 
 
 
434 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.05 
 
 
478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.01 
 
 
417 aa  209  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.48 
 
 
465 aa  204  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  37.94 
 
 
417 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  38.65 
 
 
425 aa  199  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.38 
 
 
425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  35.1 
 
 
420 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  35.1 
 
 
420 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  35.1 
 
 
420 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  35.1 
 
 
420 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  35.1 
 
 
420 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  35.1 
 
 
420 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  35.1 
 
 
420 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  37 
 
 
423 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  37.22 
 
 
519 aa  194  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.39 
 
 
437 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.98 
 
 
470 aa  192  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  34.62 
 
 
420 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.33 
 
 
420 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.33 
 
 
420 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.1 
 
 
418 aa  189  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  39.8 
 
 
454 aa  189  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.86 
 
 
421 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  33.59 
 
 
434 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  34.78 
 
 
421 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.78 
 
 
421 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.78 
 
 
421 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  35.33 
 
 
421 aa  186  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.41 
 
 
424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  41.44 
 
 
429 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.25 
 
 
433 aa  182  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.78 
 
 
419 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  37.57 
 
 
419 aa  182  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  38.89 
 
 
429 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  35.79 
 
 
452 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  33.41 
 
 
419 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  38.89 
 
 
429 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  34.4 
 
 
429 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  34.93 
 
 
427 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.34 
 
 
426 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  40 
 
 
419 aa  179  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  37.39 
 
 
466 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  37.7 
 
 
433 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2376  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.36 
 
 
399 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.194397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  32.13 
 
 
432 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.64 
 
 
423 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  34.4 
 
 
425 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  40.07 
 
 
447 aa  176  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  33.17 
 
 
416 aa  176  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.47 
 
 
449 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  35.71 
 
 
453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.58 
 
 
429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  36.07 
 
 
432 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  33.17 
 
 
423 aa  172  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  35.78 
 
 
434 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  37.04 
 
 
448 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.95 
 
 
429 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  35.1 
 
 
415 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  31.55 
 
 
433 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  38.18 
 
 
465 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  33.11 
 
 
455 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  37.95 
 
 
420 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  36.64 
 
 
395 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  38.18 
 
 
465 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0406  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.96 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  33.22 
 
 
446 aa  167  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  36 
 
 
457 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  32.78 
 
 
444 aa  166  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  36.96 
 
 
417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  34.63 
 
 
429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  33.78 
 
 
452 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  34.13 
 
 
443 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  32.42 
 
 
428 aa  163  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  34.3 
 
 
429 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  37.45 
 
 
448 aa  163  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  33.64 
 
 
428 aa  162  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  33.22 
 
 
443 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>