More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2390 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2285  Fmu (Sun) domain-containing protein  78.22 
 
 		 404 aa  654    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2212  Fmu (Sun) domain-containing protein  93.07 
 
 		 404 aa  789    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369517  hitchhiker  0.00133347 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2215  sun protein, putative  77.97 
 
 		 404 aa  657    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  80.94 
 
 		 405 aa  692    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2088  Fmu (Sun) domain-containing protein  77.97 
 
 		 404 aa  652    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1799  Fmu (Sun) domain-containing protein  76.98 
 
 		 404 aa  645    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2297  Fmu (Sun) domain protein  78.22 
 
 		 404 aa  654    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000974746  normal  0.583601 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1739  Fmu (Sun)  74.26 
 
 		 404 aa  635    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33576  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4571  hypothetical protein  78.22 
 
 		 404 aa  654    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2131  Fmu (Sun) domain-containing protein  79.51 
 
 		 404 aa  662    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.547964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2309  Fmu (Sun) domain-containing protein  79.01 
 
 		 404 aa  657    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2207  Fmu (Sun) domain-containing protein  79.26 
 
 		 404 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  75.43 
 
 		 418 aa  648    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  75.5 
 
 		 404 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2041  Fmu (Sun) domain-containing protein  77.97 
 
 		 404 aa  653    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2390  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 		 419 aa  865    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  72.28 
 
 		 416 aa  616  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  44.64 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.26 
 
 		 404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  40.61 
 
 		 412 aa  264  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  43.07 
 
 		 410 aa  249  8e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0186  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase (sun family protein)  38.18 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.6 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.71 
 
 		 478 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  38.01 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  39.19 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  35.81 
 
 		 423 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.31 
 
 		 437 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.43 
 
 		 465 aa  195  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.36 
 
 		 425 aa  195  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  43.36 
 
 		 425 aa  195  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.75 
 
 		 470 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.91 
 
 		 418 aa  193  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  34.86 
 
 		 427 aa  192  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  39.63 
 
 		 416 aa  192  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.75 
 
 		 424 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.33 
 
 		 421 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  38.51 
 
 		 447 aa  189  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  36.68 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  36.68 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  36.68 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  36.68 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  36.59 
 
 		 421 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  36.68 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  37.5 
 
 		 419 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  36.68 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  36.68 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.85 
 
 		 420 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.85 
 
 		 420 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  36.33 
 
 		 452 aa  186  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  36.68 
 
 		 420 aa  186  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  39.12 
 
 		 429 aa  186  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  37.46 
 
 		 454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.87 
 
 		 419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  35.29 
 
 		 519 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  41.09 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  38.49 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  37.16 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.45 
 
 		 421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  32.45 
 
 		 421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.45 
 
 		 421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  34.98 
 
 		 419 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  36.15 
 
 		 453 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.33 
 
 		 423 aa  179  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  37.25 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  33.67 
 
 		 455 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.54 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  37.25 
 
 		 429 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2376  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.79 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.194397 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  32.3 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  35.51 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  37.02 
 
 		 444 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.3 
 
 		 429 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  36.27 
 
 		 434 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  34.65 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.69 
 
 		 449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  36.43 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  36.36 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  33.33 
 
 		 446 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0406  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.01 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.93 
 
 		 426 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.6 
 
 		 429 aa  173  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  31.03 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  35.25 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  36.84 
 
 		 420 aa  171  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  29.26 
 
 		 429 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  32.49 
 
 		 433 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  36.36 
 
 		 448 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  34.65 
 
 		 452 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  32.64 
 
 		 432 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  28.8 
 
 		 429 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  36.64 
 
 		 395 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  33.85 
 
 		 417 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  35.23 
 
 		 465 aa  166  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  34.31 
 
 		 443 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  35.23 
 
 		 465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  36.93 
 
 		 434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  34.93 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  33.16 
 
 		 433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  33.22 
 
 		 444 aa  162  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>