More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2332 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  93.05 
 
 		 417 aa  761    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 		 465 aa  937    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  99.14 
 
 		 465 aa  927    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  69.95 
 
 		 466 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  70.48 
 
 		 425 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  66.19 
 
 		 420 aa  552  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  65.71 
 
 		 421 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  65.47 
 
 		 420 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  65.47 
 
 		 420 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  65.47 
 
 		 420 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  66.43 
 
 		 421 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  65.47 
 
 		 420 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  65.47 
 
 		 420 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  65.62 
 
 		 419 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  65.47 
 
 		 420 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  65.47 
 
 		 420 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  65.23 
 
 		 421 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  65.23 
 
 		 420 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  64.27 
 
 		 419 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  65.23 
 
 		 421 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  65.23 
 
 		 420 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  65.23 
 
 		 421 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  64.51 
 
 		 419 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.39 
 
 		 465 aa  459  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  60.87 
 
 		 424 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  58.29 
 
 		 519 aa  456  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  59.02 
 
 		 420 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  60.92 
 
 		 425 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  60.92 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  57.11 
 
 		 470 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  57.62 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.2 
 
 		 418 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  56.76 
 
 		 417 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.28 
 
 		 417 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  55.97 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  58.44 
 
 		 447 aa  423  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  58.27 
 
 		 419 aa  423  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  53.47 
 
 		 416 aa  420  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  57.55 
 
 		 423 aa  415  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  51.33 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  54.13 
 
 		 415 aa  393  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  43.03 
 
 		 434 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.03 
 
 		 478 aa  270  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.56 
 
 		 426 aa  249  5e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.25 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.4 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  38.22 
 
 		 454 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  41.15 
 
 		 433 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  38.18 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  38.57 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  38.88 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  43.61 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  41.64 
 
 		 448 aa  221  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  37.94 
 
 		 434 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  35.37 
 
 		 449 aa  220  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  37.26 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  37.17 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  41.64 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  38.12 
 
 		 429 aa  216  8e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  36.36 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.85 
 
 		 430 aa  213  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.23 
 
 		 433 aa  212  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  35.39 
 
 		 429 aa  211  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.68 
 
 		 429 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.75 
 
 		 404 aa  210  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  40.78 
 
 		 428 aa  209  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  35.09 
 
 		 429 aa  208  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.7 
 
 		 429 aa  207  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  33.71 
 
 		 429 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.18 
 
 		 437 aa  206  9e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  34.34 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  35.68 
 
 		 446 aa  200  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  39.61 
 
 		 451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  39.27 
 
 		 453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  32.54 
 
 		 451 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  38.28 
 
 		 448 aa  196  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  32.3 
 
 		 451 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0186  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase (sun family protein)  33.68 
 
 		 416 aa  196  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  37.25 
 
 		 464 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  38.14 
 
 		 448 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0087  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.08 
 
 		 370 aa  195  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  37.04 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  34.45 
 
 		 449 aa  195  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  36.26 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  38.02 
 
 		 448 aa  192  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  35.22 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  35.13 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  31.96 
 
 		 443 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  36.33 
 
 		 449 aa  190  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0287  Fmu (Sun) domain protein  36.34 
 
 		 436 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46635  predicted protein  40.48 
 
 		 359 aa  189  7e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.247444  decreased coverage  0.000750659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  33.41 
 
 		 429 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  30.23 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  33.82 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2960  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.68 
 
 		 449 aa  189  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.19 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1178  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.64 
 
 		 437 aa  188  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0995353  normal  0.6994 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  31.5 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1209  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.68 
 
 		 458 aa  187  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  36.84 
 
 		 452 aa  187  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>