More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1547 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 		 412 aa  852    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  64.43 
 
 		 403 aa  537  1e-151  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  61.75 
 
 		 404 aa  519  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  48.91 
 
 		 410 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0186  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase (sun family protein)  44.39 
 
 		 416 aa  316  5e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2131  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.51 
 
 		 404 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.547964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2207  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.26 
 
 		 404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1799  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.07 
 
 		 404 aa  282  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2309  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.98 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2285  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.33 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2088  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.33 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4571  hypothetical protein  41.33 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2297  Fmu (Sun) domain protein  41.33 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000974746  normal  0.583601 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.46 
 
 		 405 aa  275  8e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2041  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.07 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2215  sun protein, putative  41.73 
 
 		 404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.75 
 
 		 418 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  41.48 
 
 		 416 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2390  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.61 
 
 		 419 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2212  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.95 
 
 		 404 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369517  hitchhiker  0.00133347 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1739  Fmu (Sun)  41.99 
 
 		 404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33576  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  36.34 
 
 		 434 aa  257  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.42 
 
 		 404 aa  256  7e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  33.33 
 
 		 423 aa  227  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.03 
 
 		 437 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  34.2 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  34.2 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  34.2 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  34.2 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  34.2 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  34.2 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  34.2 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  47.45 
 
 		 454 aa  223  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  33.33 
 
 		 420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  35.68 
 
 		 447 aa  216  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  33.02 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.3 
 
 		 425 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  37.2 
 
 		 417 aa  212  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  34.04 
 
 		 425 aa  212  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.62 
 
 		 421 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  33.96 
 
 		 419 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  32.62 
 
 		 421 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.62 
 
 		 421 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.32 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.74 
 
 		 424 aa  210  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.01 
 
 		 419 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.54 
 
 		 421 aa  209  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.38 
 
 		 420 aa  206  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.38 
 
 		 420 aa  206  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  33.01 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.86 
 
 		 465 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  35.63 
 
 		 420 aa  205  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.8 
 
 		 417 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  35.14 
 
 		 416 aa  202  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  33.83 
 
 		 417 aa  202  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.94 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  32.02 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  34.45 
 
 		 419 aa  199  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  33.84 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  33.74 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.06 
 
 		 404 aa  197  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  33.99 
 
 		 466 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.87 
 
 		 478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.7 
 
 		 426 aa  196  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.04 
 
 		 470 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  33.97 
 
 		 415 aa  192  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  33.75 
 
 		 465 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  33.75 
 
 		 465 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  31.99 
 
 		 519 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  35.79 
 
 		 448 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.15 
 
 		 423 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  42.47 
 
 		 429 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.69 
 
 		 449 aa  187  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  37.97 
 
 		 452 aa  187  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  31.24 
 
 		 448 aa  182  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  37.17 
 
 		 427 aa  182  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  35.04 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  35.12 
 
 		 446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  31.94 
 
 		 453 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0298  Fmu (Sun) domain protein  31.69 
 
 		 437 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583508  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  31.65 
 
 		 449 aa  179  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0287  Fmu (Sun) domain protein  31.13 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  36.91 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.42 
 
 		 423 aa  177  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  36.33 
 
 		 452 aa  176  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  35.33 
 
 		 460 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  37.84 
 
 		 434 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  30.8 
 
 		 448 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  30.65 
 
 		 448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  38.05 
 
 		 457 aa  173  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  29.14 
 
 		 451 aa  173  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  36.84 
 
 		 445 aa  172  9e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  34.8 
 
 		 446 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  31.16 
 
 		 449 aa  171  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  34.94 
 
 		 452 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  37.23 
 
 		 468 aa  170  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  36.12 
 
 		 444 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0276  methyltransferase  31.83 
 
 		 437 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.398317  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  33.33 
 
 		 429 aa  170  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  37.1 
 
 		 432 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>