More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3156 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  83.29 
 
 		 420 aa  715    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  84.25 
 
 		 421 aa  712    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  84.73 
 
 		 421 aa  707    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  83.29 
 
 		 420 aa  715    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  83.29 
 
 		 420 aa  715    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  83.29 
 
 		 420 aa  715    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  83.53 
 
 		 420 aa  717    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 		 419 aa  845    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  83.53 
 
 		 420 aa  717    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  84.49 
 
 		 420 aa  713    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  83.53 
 
 		 421 aa  725    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  82.58 
 
 		 420 aa  716    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  97.61 
 
 		 419 aa  827    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  84.25 
 
 		 421 aa  712    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  90.43 
 
 		 419 aa  752    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  84.49 
 
 		 420 aa  713    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  83.53 
 
 		 420 aa  717    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  84.25 
 
 		 421 aa  712    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  64.75 
 
 		 417 aa  528  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  64.51 
 
 		 465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  64.51 
 
 		 465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  64.44 
 
 		 425 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  63.01 
 
 		 466 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  56.9 
 
 		 420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  58.98 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.16 
 
 		 425 aa  441  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  56.16 
 
 		 425 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.01 
 
 		 418 aa  438  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  56.77 
 
 		 423 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.06 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.42 
 
 		 417 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.61 
 
 		 465 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.63 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  54.55 
 
 		 519 aa  425  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  54.46 
 
 		 417 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  53.69 
 
 		 416 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  55.64 
 
 		 429 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  51.44 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  55.31 
 
 		 447 aa  411  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.39 
 
 		 423 aa  411  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  55.22 
 
 		 415 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.72 
 
 		 478 aa  300  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  40.59 
 
 		 434 aa  289  7e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.48 
 
 		 426 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.94 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  37.65 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  41.45 
 
 		 429 aa  253  6e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.25 
 
 		 404 aa  246  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  41.63 
 
 		 433 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.3 
 
 		 429 aa  239  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  39 
 
 		 434 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  41.59 
 
 		 451 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  37.74 
 
 		 433 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  37.78 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  34.94 
 
 		 443 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  36.59 
 
 		 429 aa  229  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  39.19 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  42.32 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.1 
 
 		 437 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  34.85 
 
 		 428 aa  223  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  37.2 
 
 		 432 aa  222  9e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  36.19 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  37.21 
 
 		 429 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.48 
 
 		 433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  35.19 
 
 		 429 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  35.42 
 
 		 410 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.5 
 
 		 430 aa  217  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  37.56 
 
 		 430 aa  216  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  34.97 
 
 		 429 aa  216  8e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.78 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.08 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  34.3 
 
 		 448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  31.86 
 
 		 446 aa  214  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  39.93 
 
 		 449 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  38.24 
 
 		 449 aa  213  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  33.82 
 
 		 464 aa  210  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.44 
 
 		 429 aa  210  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  33.01 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  36.88 
 
 		 433 aa  209  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  35.67 
 
 		 443 aa  206  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.54 
 
 		 404 aa  207  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1178  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.76 
 
 		 437 aa  206  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0995353  normal  0.6994 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  37.5 
 
 		 448 aa  206  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  38.19 
 
 		 427 aa  206  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0087  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.99 
 
 		 370 aa  206  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  33.02 
 
 		 403 aa  204  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  36.42 
 
 		 448 aa  202  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  33.66 
 
 		 446 aa  202  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.58 
 
 		 423 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  36.07 
 
 		 453 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  36.09 
 
 		 448 aa  200  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  31.4 
 
 		 452 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  33.09 
 
 		 451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0287  Fmu (Sun) domain protein  36.88 
 
 		 436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  39.14 
 
 		 468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  32.61 
 
 		 451 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.37 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  35.47 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  34.76 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  34.83 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>