More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4579 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  94.41 
 
 
429 aa  805    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  74.53 
 
 
429 aa  658    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 
429 aa  869    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  71.76 
 
 
428 aa  628  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  54.8 
 
 
427 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  52.1 
 
 
429 aa  431  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  52.1 
 
 
429 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  49.3 
 
 
428 aa  429  1e-119  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.28 
 
 
429 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.72 
 
 
430 aa  364  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  47.02 
 
 
434 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  48.02 
 
 
427 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  46.79 
 
 
433 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  47.83 
 
 
432 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.88 
 
 
433 aa  355  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  49.08 
 
 
433 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  44.91 
 
 
430 aa  351  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  47.7 
 
 
434 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1178  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.98 
 
 
437 aa  348  1e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0995353  normal  0.6994 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  47.59 
 
 
433 aa  345  7e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.55 
 
 
423 aa  339  5.9999999999999996e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3160  Fmu (Sun) domain protein  45.27 
 
 
449 aa  332  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210419  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  44.47 
 
 
432 aa  333  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2934  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.27 
 
 
459 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0966  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.91 
 
 
437 aa  322  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.95 
 
 
433 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.59 
 
 
426 aa  257  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3116  Fmu (Sun) domain protein  40.9 
 
 
367 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  38.74 
 
 
454 aa  249  9e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  38.51 
 
 
429 aa  245  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0087  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.73 
 
 
370 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.03 
 
 
478 aa  236  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  37.05 
 
 
419 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.41 
 
 
419 aa  233  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  36.26 
 
 
420 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  37.08 
 
 
421 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  37.36 
 
 
419 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.05 
 
 
421 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  36.53 
 
 
420 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  36.53 
 
 
420 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  36.53 
 
 
420 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  36.3 
 
 
420 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  36.3 
 
 
420 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  36.3 
 
 
420 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  36.63 
 
 
421 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.63 
 
 
421 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  36.3 
 
 
420 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.63 
 
 
421 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  34.46 
 
 
416 aa  226  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.51 
 
 
420 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.51 
 
 
420 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.62 
 
 
417 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.73 
 
 
418 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  31.04 
 
 
423 aa  216  8e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.75 
 
 
425 aa  216  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  40.25 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.44 
 
 
465 aa  213  7e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  39.75 
 
 
417 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  37.1 
 
 
395 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.99 
 
 
470 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  37.04 
 
 
423 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1227  Fmu (Sun)  36.01 
 
 
391 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1645  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase  36.27 
 
 
392 aa  208  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000605846 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  39.63 
 
 
466 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  39.38 
 
 
519 aa  206  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.59 
 
 
423 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  34.4 
 
 
420 aa  205  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.44 
 
 
424 aa  203  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  40.06 
 
 
465 aa  203  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  35.44 
 
 
417 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  40.06 
 
 
465 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  39.94 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  33.33 
 
 
434 aa  200  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  39.42 
 
 
447 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  37.14 
 
 
429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  35.53 
 
 
419 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.17 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  33.41 
 
 
415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.41 
 
 
405 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  37.7 
 
 
460 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  33.43 
 
 
403 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2212  Fmu (Sun) domain-containing protein  30 
 
 
404 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369517  hitchhiker  0.00133347 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2215  sun protein, putative  30.47 
 
 
404 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2108  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.26 
 
 
387 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2207  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.41 
 
 
404 aa  177  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2390  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.03 
 
 
419 aa  176  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416115  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2309  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.41 
 
 
404 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  34.28 
 
 
416 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1799  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.08 
 
 
404 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  33.72 
 
 
412 aa  175  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2041  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.95 
 
 
404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2131  Fmu (Sun) domain-containing protein  30 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.547964  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.34 
 
 
418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4571  hypothetical protein  34.63 
 
 
404 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2297  Fmu (Sun) domain protein  34.63 
 
 
404 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000974746  normal  0.583601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2285  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.63 
 
 
404 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2088  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.63 
 
 
404 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0455  NOL1/NOP2/sun family protein  34.17 
 
 
387 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.11 
 
 
437 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2376  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.42 
 
 
399 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.194397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>