More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1645 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1645  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase  100 
 
 		 392 aa  790    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000605846 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1227  Fmu (Sun)  49.23 
 
 		 391 aa  347  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2108  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.51 
 
 		 387 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0455  NOL1/NOP2/sun family protein  50 
 
 		 387 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2376  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.13 
 
 		 399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.194397 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1983  Fmu (Sun)  45.43 
 
 		 387 aa  286  5.999999999999999e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100051  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0594  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.71 
 
 		 383 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3160  Fmu (Sun) domain protein  41.42 
 
 		 449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2934  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.42 
 
 		 459 aa  234  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.98 
 
 		 433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.52 
 
 		 433 aa  232  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  40.05 
 
 		 430 aa  227  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  38.55 
 
 		 454 aa  227  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  39.01 
 
 		 427 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.46 
 
 		 430 aa  226  6e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  37.64 
 
 		 432 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.48 
 
 		 423 aa  220  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  37.8 
 
 		 428 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  38.21 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  36.41 
 
 		 434 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.98 
 
 		 429 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0966  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.82 
 
 		 437 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  37.79 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  36.89 
 
 		 429 aa  209  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  37.37 
 
 		 432 aa  209  6e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1178  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.91 
 
 		 437 aa  208  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0995353  normal  0.6994 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  38.8 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.9 
 
 		 429 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  36.07 
 
 		 433 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  36.79 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  38.24 
 
 		 429 aa  202  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  36.78 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  38.74 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.09 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  36.27 
 
 		 429 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0406  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.11 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  36.39 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  35.34 
 
 		 434 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.67 
 
 		 478 aa  186  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1028  Fmu (Sun)  39.58 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  33.59 
 
 		 416 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  32.09 
 
 		 428 aa  182  6e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  37.25 
 
 		 420 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.93 
 
 		 418 aa  176  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  35.1 
 
 		 419 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  34.85 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  34.85 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  34.85 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  34.85 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  34.85 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  34.85 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  34.85 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  32.11 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0087  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.61 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  33.42 
 
 		 425 aa  170  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.42 
 
 		 425 aa  169  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3116  Fmu (Sun) domain protein  37.85 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  31.82 
 
 		 412 aa  166  5e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  34.85 
 
 		 419 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.5 
 
 		 417 aa  166  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  33.76 
 
 		 420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  32.74 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  32 
 
 		 470 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.42 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.59 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.59 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.68 
 
 		 424 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.76 
 
 		 419 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  32.99 
 
 		 421 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  31.09 
 
 		 423 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.99 
 
 		 421 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  32.99 
 
 		 421 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.99 
 
 		 421 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  33.25 
 
 		 417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  33.25 
 
 		 466 aa  156  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  35.79 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.06 
 
 		 421 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.06 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  33.59 
 
 		 425 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2207  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.69 
 
 		 404 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.52 
 
 		 418 aa  150  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  31.27 
 
 		 429 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  37.76 
 
 		 416 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  32.7 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  32.66 
 
 		 419 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  33.6 
 
 		 465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.97 
 
 		 404 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2131  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.71 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.547964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.83 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2215  sun protein, putative  35.14 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  34.16 
 
 		 415 aa  143  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2309  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.71 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2212  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.23 
 
 		 404 aa  142  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369517  hitchhiker  0.00133347 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2390  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.38 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  36.94 
 
 		 446 aa  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0186  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase (sun family protein)  28.71 
 
 		 416 aa  141  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2178  Fmu (Sun) domain protein  33.73 
 
 		 430 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2041  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.88 
 
 		 404 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2088  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.88 
 
 		 404 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2297  Fmu (Sun) domain protein  34.88 
 
 		 404 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000974746  normal  0.583601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>