More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2725 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  84.43 
 
 		 424 aa  732    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  76.02 
 
 		 470 aa  671    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 		 425 aa  853    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  76.36 
 
 		 429 aa  658    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  74.94 
 
 		 417 aa  635    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  80.42 
 
 		 423 aa  661    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  79.01 
 
 		 423 aa  678    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  99.76 
 
 		 425 aa  852    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  73.52 
 
 		 417 aa  626  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  64.49 
 
 		 418 aa  541  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  65.57 
 
 		 419 aa  527  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  60.28 
 
 		 417 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  56.64 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  57.21 
 
 		 420 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  57.45 
 
 		 420 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  57.45 
 
 		 420 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  57.45 
 
 		 420 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  57.21 
 
 		 420 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  57.21 
 
 		 420 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  57.21 
 
 		 420 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  56.97 
 
 		 420 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.53 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  60.92 
 
 		 465 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  60.68 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  56.16 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  56.74 
 
 		 421 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.16 
 
 		 421 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  56.16 
 
 		 421 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.16 
 
 		 421 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  58.68 
 
 		 425 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.56 
 
 		 420 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  56.97 
 
 		 466 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.56 
 
 		 420 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.32 
 
 		 421 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  55.21 
 
 		 420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.69 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  53.29 
 
 		 519 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  53.41 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  52.86 
 
 		 415 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  50 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  50.98 
 
 		 416 aa  376  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  42.39 
 
 		 434 aa  279  7e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.53 
 
 		 478 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.31 
 
 		 426 aa  253  6e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.98 
 
 		 433 aa  249  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  38.12 
 
 		 454 aa  246  6e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  40.18 
 
 		 433 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  40.31 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  40.96 
 
 		 434 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.83 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  39.73 
 
 		 434 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.09 
 
 		 430 aa  229  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  37.76 
 
 		 430 aa  229  6e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  38.57 
 
 		 429 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  37.75 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  38.67 
 
 		 432 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  39.23 
 
 		 427 aa  223  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.89 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  37.39 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.9 
 
 		 437 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  37.14 
 
 		 433 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  36.1 
 
 		 446 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  34.04 
 
 		 412 aa  212  9e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  40.73 
 
 		 448 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.39 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.28 
 
 		 429 aa  209  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  34.86 
 
 		 449 aa  209  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1178  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.43 
 
 		 437 aa  207  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0995353  normal  0.6994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  34.97 
 
 		 428 aa  206  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.9 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0287  Fmu (Sun) domain protein  37.86 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3160  Fmu (Sun) domain protein  35.87 
 
 		 449 aa  203  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  40 
 
 		 451 aa  203  5e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  32.87 
 
 		 443 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2934  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.43 
 
 		 459 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  36.96 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2041  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.92 
 
 		 404 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.81 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0966  Fmu (Sun) domain-containing protein  37 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  40.25 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1739  Fmu (Sun)  38.81 
 
 		 404 aa  200  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33576  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.84 
 
 		 404 aa  200  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  34.3 
 
 		 403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2285  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.65 
 
 		 404 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2297  Fmu (Sun) domain protein  38.65 
 
 		 404 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000974746  normal  0.583601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  37.89 
 
 		 448 aa  200  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4571  hypothetical protein  38.65 
 
 		 404 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  36.93 
 
 		 429 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  37.27 
 
 		 448 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1799  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.32 
 
 		 404 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  35 
 
 		 410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2088  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.38 
 
 		 404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  38.8 
 
 		 416 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0276  methyltransferase  37.44 
 
 		 437 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.398317  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0298  Fmu (Sun) domain protein  38.65 
 
 		 437 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  32.64 
 
 		 448 aa  196  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  35.24 
 
 		 455 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  40.32 
 
 		 452 aa  196  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  34.31 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2215  sun protein, putative  37.9 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>