More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0347 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 		 434 aa  870    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  46.7 
 
 		 420 aa  328  9e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  42.29 
 
 		 423 aa  317  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.28 
 
 		 418 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  43.41 
 
 		 416 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  43.65 
 
 		 415 aa  301  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  45.63 
 
 		 447 aa  300  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  43.19 
 
 		 420 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  43.19 
 
 		 420 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  43.19 
 
 		 420 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  43.19 
 
 		 420 aa  299  7e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  43.19 
 
 		 420 aa  299  7e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  43.19 
 
 		 420 aa  299  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  43.19 
 
 		 420 aa  299  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  42.35 
 
 		 419 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.9 
 
 		 421 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  42.72 
 
 		 420 aa  296  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  41.55 
 
 		 421 aa  296  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.29 
 
 		 419 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.96 
 
 		 420 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.96 
 
 		 420 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.19 
 
 		 421 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  43.19 
 
 		 421 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.19 
 
 		 421 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  42.35 
 
 		 419 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  44.6 
 
 		 419 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.56 
 
 		 424 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  42.2 
 
 		 454 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  42.39 
 
 		 425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.12 
 
 		 470 aa  283  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.15 
 
 		 425 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  42.18 
 
 		 465 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  41.94 
 
 		 465 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.79 
 
 		 423 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.15 
 
 		 465 aa  277  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  40.77 
 
 		 417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.51 
 
 		 433 aa  274  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.81 
 
 		 417 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  40.51 
 
 		 423 aa  272  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  40.71 
 
 		 417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.19 
 
 		 404 aa  265  8e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  39.63 
 
 		 519 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  41.2 
 
 		 425 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  40.38 
 
 		 429 aa  264  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  36.03 
 
 		 403 aa  263  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  37.02 
 
 		 412 aa  261  1e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  40.6 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.62 
 
 		 404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.84 
 
 		 437 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.64 
 
 		 478 aa  250  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  37.73 
 
 		 434 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  35.46 
 
 		 410 aa  249  8e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.6 
 
 		 426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.28 
 
 		 430 aa  243  6e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  40.14 
 
 		 429 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  37.87 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  38.64 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0186  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase (sun family protein)  34.18 
 
 		 416 aa  240  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  38.01 
 
 		 433 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  38.46 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.17 
 
 		 418 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  37.87 
 
 		 433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.91 
 
 		 404 aa  229  9e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  31.76 
 
 		 452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.42 
 
 		 405 aa  226  6e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  36.84 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  35.75 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  37.07 
 
 		 460 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  42.57 
 
 		 416 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  38.07 
 
 		 427 aa  222  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.28 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  34.72 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  36.07 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  36.26 
 
 		 451 aa  220  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2131  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.83 
 
 		 404 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.547964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  33.33 
 
 		 452 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2215  sun protein, putative  40.27 
 
 		 404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.37 
 
 		 433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1799  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.06 
 
 		 404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  33.85 
 
 		 451 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2041  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.88 
 
 		 404 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0287  Fmu (Sun) domain protein  41.69 
 
 		 436 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2309  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.83 
 
 		 404 aa  219  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2088  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.17 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4571  hypothetical protein  40.88 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2285  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.88 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2297  Fmu (Sun) domain protein  40.88 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000974746  normal  0.583601 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  33.63 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  35.36 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2207  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.59 
 
 		 404 aa  217  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  33.49 
 
 		 446 aa  216  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  33.18 
 
 		 443 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  37.32 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1739  Fmu (Sun)  45.15 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  33.33 
 
 		 464 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  36.09 
 
 		 449 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2390  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.19 
 
 		 419 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  42.06 
 
 		 457 aa  213  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  35.63 
 
 		 448 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0298  Fmu (Sun) domain protein  41.22 
 
 		 437 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>